PHENOTYPIC AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF PATHOGENIC VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS ISOLATED FROM PENAEUS VANNAMEI
Notice bibliographique
Résumé
A mass mortality of cultured Litopenaeus vannamei broke out during summer in a local farm in northern Jiangsu Province.Syndromes include swimming near water surface and the pond walls,with black gill and opaque muscle.Tissue samples were taken in the liver,and strong pathogenicity to L.vannamei,P.japonicus and P.chinensis were determined by immersion.The phenotypic characteristics of isolates(4 strains) were examined in morphology,physiology and biochemistry;the 16S rRNA and gyrB were amplified by PCR and compared with sequences in databases,from which molecular phylogenetic trees were constructed.The sequenced 16S rRNA gene of strain JGB080708-1(GenBank accession No.GQ205448) is 1456bp in length,the sequenced gyrB gene of strain JGB080708-1(GenBank accession No.GQ205453) is 1195bp in length.Results of phylogenetic analysis on 16S rRNA and gyrB genes revealed a high homogeneity between the isolates and V.parahaemolyticus from GenBank database.Comparison in method between 16S rRNA and gyrB genes confirms that gyrB gene analysis is more useful.The isolates were identified as V.parahaemolyticus [(Fujino et al 1951) Sakazaki Nakamura and Takizawa 1963] of Vibrio(Pacini 1854) in phenotypic and molecular characteristics.Test on the activity of extracellulase and hemolysin shows that the isolates could produce diastase,gelatinase,and lecithinase,but no proteinase and lipase,and KP haemolysis was negative.Examination of K-antigen and agglutination titers show that the isolates have K-antigen,and the titer of OK-agglutinogen with OK-antiserum and O-agglutinogen with O-antiserum was the same(7log2);the titer of OK-antiserum with O-agglutinogen and O-antiserum with OK-agglutinogen was 2log2 and 3log2,respectively.The drug resistance of isolates to 49 antimicrobial agents was detected,the results show that the iso-lates are resistant to penicillin G,ampicillin,oxacillin,lincomycin,bacitracin and amoxicillin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».