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Enregistrement W2392007313

PHENOTYPIC AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF PATHOGENIC VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS ISOLATED FROM PENAEUS VANNAMEI

2009· article· en· W2392007313 sur OpenAlexaff
Xiao Zhang

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGenBankVibrio parahaemolyticusMicrobiologyLecithinase16S ribosomal RNAPenaeus monodonGeneGeneticsShrimpBacteria
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A mass mortality of cultured Litopenaeus vannamei broke out during summer in a local farm in northern Jiangsu Province.Syndromes include swimming near water surface and the pond walls,with black gill and opaque muscle.Tissue samples were taken in the liver,and strong pathogenicity to L.vannamei,P.japonicus and P.chinensis were determined by immersion.The phenotypic characteristics of isolates(4 strains) were examined in morphology,physiology and biochemistry;the 16S rRNA and gyrB were amplified by PCR and compared with sequences in databases,from which molecular phylogenetic trees were constructed.The sequenced 16S rRNA gene of strain JGB080708-1(GenBank accession No.GQ205448) is 1456bp in length,the sequenced gyrB gene of strain JGB080708-1(GenBank accession No.GQ205453) is 1195bp in length.Results of phylogenetic analysis on 16S rRNA and gyrB genes revealed a high homogeneity between the isolates and V.parahaemolyticus from GenBank database.Comparison in method between 16S rRNA and gyrB genes confirms that gyrB gene analysis is more useful.The isolates were identified as V.parahaemolyticus [(Fujino et al 1951) Sakazaki Nakamura and Takizawa 1963] of Vibrio(Pacini 1854) in phenotypic and molecular characteristics.Test on the activity of extracellulase and hemolysin shows that the isolates could produce diastase,gelatinase,and lecithinase,but no proteinase and lipase,and KP haemolysis was negative.Examination of K-antigen and agglutination titers show that the isolates have K-antigen,and the titer of OK-agglutinogen with OK-antiserum and O-agglutinogen with O-antiserum was the same(7log2);the titer of OK-antiserum with O-agglutinogen and O-antiserum with OK-agglutinogen was 2log2 and 3log2,respectively.The drug resistance of isolates to 49 antimicrobial agents was detected,the results show that the iso-lates are resistant to penicillin G,ampicillin,oxacillin,lincomycin,bacitracin and amoxicillin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,560

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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