Cloning and sequence analysis of Cyt b gene in four Sparidae fishes in Zhoushan sea area
Notice bibliographique
Résumé
The complete sequences of mitochondrial Cyt b gene in Pagrus pagrus,Sparus macrocephalus,Acanthopagrus latus and Parargyrops edita in Zhoushan sea area were amplified,cloned and sequenced.The 1 141 bp Cyt b gene sequences of these four species were obtained.Compared with the same DNA fragment recorded in the GeneBank,the sequences of 1 141 bp DNA had 292 nucleotide variation sites,among which 186 parsimony informative sites were observed.Transitions were discovered to be more than transversions,and most of the base substitutions occurred at the third locus of the codon.The genetic distance among 4 Sparidae species ranged from 0.096 7 to 0.227 5.The shortest distance occurred between P.pagrus and P.edita,being 0.096 7,while the longest one between S.macrocephalus and A.latus,being 0.227 5.Moreover,the transition-transversion ratio of the sequence differentiation of 4 species ranged from 2.293 0 to 7.358 7.The NJ phylogenetic tree revealed that 25 species were divided into two clades,and obvious genetic divergence existed between fishes of Sparidae and the other fishes of Percoidea.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».