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Enregistrement W2393131424

Cloning and sequence analysis of Cyt b gene in four Sparidae fishes in Zhoushan sea area

2010· article· en· W2393131424 sur OpenAlexaff
Wang Jian-xin

Notice bibliographique

RevueNanfang shuichan · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensL'Alliance Boviteq
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSparidaeBiologyPhylogenetic treeMitochondrial DNAGeneticsPagrus majorGenePagrusCytochrome bGenetic distanceZoologyGenetic variationFishery
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The complete sequences of mitochondrial Cyt b gene in Pagrus pagrus,Sparus macrocephalus,Acanthopagrus latus and Parargyrops edita in Zhoushan sea area were amplified,cloned and sequenced.The 1 141 bp Cyt b gene sequences of these four species were obtained.Compared with the same DNA fragment recorded in the GeneBank,the sequences of 1 141 bp DNA had 292 nucleotide variation sites,among which 186 parsimony informative sites were observed.Transitions were discovered to be more than transversions,and most of the base substitutions occurred at the third locus of the codon.The genetic distance among 4 Sparidae species ranged from 0.096 7 to 0.227 5.The shortest distance occurred between P.pagrus and P.edita,being 0.096 7,while the longest one between S.macrocephalus and A.latus,being 0.227 5.Moreover,the transition-transversion ratio of the sequence differentiation of 4 species ranged from 2.293 0 to 7.358 7.The NJ phylogenetic tree revealed that 25 species were divided into two clades,and obvious genetic divergence existed between fishes of Sparidae and the other fishes of Percoidea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,226
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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