Expression of QK/QR/RRRAA or DERAA motifs at the third hypervariable region of HLA-DRB1 and disease severity in rheumatoid arthritis.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To examine the relationship between disease severity in patients with confirmed rheumatoid arthritis (RA) and the carriage of alleles expressing the high risk epitope (HRE) QK/QR/RRRAA or the low risk epitope (LRE) DERAA at positions 70-74 of the third hypervariable region of HLA-DRB1. METHODS: A case-control design to compare allele carriage rates in 204 Caucasian subjects with severe RA and mild RA and healthy controls. Patients had a mean disease duration of 12-18 years and severity of RA was defined using clinical and therapeutic criteria. Molecular typing at the HLA-DRB1 locus was performed using a polymerase chain reaction method. RESULTS: Eighty-seven percent of patients (52/60) with severe RA had one or more of the alleles bearing the QK/QR/RRRAA motif or HRE, compared with 54% (21/39) with mild RA (OR 5.57, p = 0.0007) and 39% (41/105) of controls (OR 10.15, p < 0.0001). Twenty-five percent of patients (15/60) with severe disease expressed 2 disease associated HRE DRB1 alleles, compared with 13% of patients (5/39) with mild disease (OR 2.3, p = NS) and 5% (5/105) of controls (OR 6.67, p = 0.0003). In contrast, only 5% of patients (3/60) with severe RA expressed one of the LRE alleles that carry the DERAA motif at positions 70-74, compared with 31% of patients (12/39) with mild RA (OR 0.12, p = 0.0013) and 22% of controls (23/105) (OR 0.19, p = 0.0082). No patient or control was homozygous for LRE alleles. Eighty-three percent (50/60) of patients with severe RA expressed the HRE without the LRE, compared with 44% (17/39) of those with mild disease (OR 6.47, p < 0.0001) and 35% (37/105) of controls (OR 9.19, p < 0.0001). In contrast, only one patient (2%) with severe disease expressed the LRE without the HRE, compared with 20% (8/39) of those with mild disease (OR 0.07, p = 0.0047) and 16% (17/105) of controls (OR 0.09, p = 0.009). There was no significant difference between the 3 groups in the frequency of patients who expressed both or neither epitope. Logistic regression showed that age at disease onset (p = 0.0009), duration of disease (p = 0.007), positive rheumatoid factor status (p = 0.003), and presence of the HRE or LRE (p = 0.00005) were significantly associated with the presence of severe disease. CONCLUSION: HLA-DRB1 alleles appear to confer an important bidirectional influence on the risk of disease severity in RA, with 20-fold difference in OR between those associated with the highest (HLA-DRB1*0401) and lowest (HLA-DRB1*1301/02) risk. The HRE and LRE exhibit diametrically opposed effects, which may be mutually antagonistic. These data support a multistep pathogenesis in which MHC class II genes are one component of a coordinate genetic and environmental interaction leading to immunological injury and joint destruction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».