Rapid molecular diagnosis of tuberculous meningitis using the Gen-probe Amplified Mycobacterium Tuberculosis direct test in a large Canadian public health laboratory.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: A 5-year retrospective study of the performance of the Gen-Probe Amplified Mycobacterium Tuberculosis Direct Test (MTD) for detecting Mycobacterium tuberculosis complex in cerebrospinal fluid (CSF). Patient data from culture-confirmed cases of tuberculous meningitis (TBM) were also analysed. RESULTS: In total, 311 CSF specimens were tested by the MTD, of which 17 were positive. When compared with culture (gold standard), the sensitivity and specificity of the MTD test were 93.8% and 99.3%, respectively. The positive and negative predictive values for TBM were 88.2%, and 99.7%. Clinical and epidemiological information was requested for all culture-positive TBM patients. These data were used to assess the mortality rate (55.6%) and to determine common factors that could be applied as selection criteria for the appropriate testing of CSF by MTD. CONCLUSION: The study found the MTD test to be a rapid, sensitive and specific test for TBM. A history of immigration from an area endemic for tuberculosis (TB), a history of TB, symptoms of neurological deficits and the results of CSF analyses could be used to appropriately select CSF for MTD testing in order to provide a critical early diagnosis of TBM.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».