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Enregistrement W2399447400 · doi:10.21037/atm.2016.04.19

From genes to chronotypes: the influence of circadian clock genes on our daily patterns of sleep and wakefulness

2016· article· en· W2399447400 sur OpenAlexafffund
Michael Verwey, Shimon Amir

Notice bibliographique

RevueAnnals of Translational Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensMontreal Clinical Research InstituteConcordia UniversityDouglas Mental Health University InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCircadian rhythmCircadian clockChronotypeBiologyGenome-wide association studyWakefulnessCLOCKNeuroscienceGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The functions of circadian clocks and oscillators depend on a small number of genes. This collection of circadian clock genes forms an autoregulatory feedback loop, and provides the mechanism that underlies the operation of circadian clocks and oscillators in the brain and body (1). The resulting endogenous clocks and oscillators go on to drive diverse rhythms in behavior and physiology. Therefore, it was with some foresight that Hu et al . [2016] surveyed “23andMe” clients on their daily sleep-wake preferences, and performed an extensive genome-wide association study (GWAS) on 89,283 individuals (2). Even with a relatively coarse self-reported measure of “morningness”, the authors were able to identify 15 loci that were associated with preferred wake times, and notably, many of these loci related back to known circadian clock genes. Taken together, this study provides important new evidence that single nucleotide polymorphisms (SNPs) located close to certain clock genes, are associated with meaningful changes in our innate circadian preferences to wake early or to sleep late.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,421
Score d'incertitude au seuil0,272

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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