MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2399759600 · doi:10.1007/978-1-59745-467-4_19

Assessment of Phagosome Formation and Maturation by Fluorescence Microscopy

2007· article· en· W2399759600 sur OpenAlexaff
Benjamin E. Steinberg, Sergio Grinstein

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhagosomePhagocytosisAntibody opsonizationFluorescence microscopeFluorescenceMicroscopyCell biologyBiophysicsInternalizationBiologyOpsoninChemistryCellBiochemistryPathologyOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phagocytosis of invading microorganisms by neutrophils is an important early response to infection. Here, we describe protocols designed for the quantitative study of particle internalization and of the subsequent maturation of the newly formed phagosomes using sheep red blood cells as a model target particle and neutrophils as phagocytes. Techniques to label the particles with fluorescent pH-sensitive dyes are presented, along with complement and immunoglobulin opsonization procedures. These labeling techniques, in combination with high-resolution digital imaging, allow for the quantitative assessment of phagocytosis at the single-cell level by bright field and fluorescence microscopy. Lastly, qualitative and quantitative methods of investigating the intraphagosomal pH are presented. We describe the use of a fluorescent weak base that accumulates in acidic cellular compartments and functions as a marker of phagosome acidification, as well as more quantitative phagosomal pH measurements by fluorescence ratio imaging. A brief description of the hardware and software components necessary for digital imaging is also provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,324

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,479
Écart entre enseignants0,456 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMethods in molecular biologyMême sujetCell Adhesion Molecules ResearchTravaux en français237 207