Functional characterization of the bacterial virulence factor NleA
Notice bibliographique
Résumé
Les bactéries entéropathogènes et entérohémorragiques Escherichia coli (EPEC et EHEC) sont des pathogènes d'origine alimentaire pouvant causer de sévères diarrhées et même la mort chez l'humain. Citrobacter rodentium est un pathogène de la souris qui sert de modèle animal pour les infections causées par EPEC et EHEC chez l'homme. EPEC, EHEC et Citrobacter rodentium transportent les protéines de virulence bactériennes directement dans la cellule hôte via un système de sécrétion de type III (T3SS). Le NleA (non-LEE-encoded effector A ou effecteur A non encodé par LEE) est un effecteur T3SS commun chez ces bactéries et est requis pour conférer la virulence bactérienne. Le NleA repère la voie de sécrétion de la cellule hôte et inhibe le transport vésiculaire en interagissant avec la sous-unité Sec24 du COPII (coatamer protein II complex ou complexe de protéines coatamer II) des mammifères. Les cellules de mammifères expriment quatre paralogues de Sec24 (Sec24A-D), qui interviennent dans la sélection des protéines transporteuses cargo et possèdent des spécificités cargo distinctes mais se chevauchant. Nous avons récemment démontré que NleA lie Sec24A-D selon deux mécanismes distincts. De plus, une protéine mutante ayant une interaction grandement diminuée avec tous les paralogues Sec24 ne se localise pas adéquatement dans la cellule hôte, n'inhibe pas le transport des vésicules et ne confère pas de virulence dans le modèle d'infection de la souris. L'inhibition de COPII résulte en une rupture des jonctions serrées de la barrière épithéliale impliquant NleA durant l'infection à EPEC. La rupture des jonctions serrées associée à EPEC survient en deux phases. Tandis que les effecteurs bactériens EspF et Map démantèlent les protéines existantes de la jonction serrée, NleA inhibe activement la translocation vers leur site des protéines de la jonction serrée nouvellement synthétisées par l'épithélium de l'hôte. Ceci résulte en une rupture irréparable de la jonction serrée durant l'infection. Ces travaux suggèrent fortement que l'intéraction et l'inhibition de COPII par NleA est un aspect important de la maladie médiée par EPEC et EHEC.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».