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Enregistrement W2402732438 · doi:10.1385/0-89603-480-1:17

Design of Bacterial Hosts for lac-Based Expression Vectors

2003· article· en· W2402732438 sur OpenAlexaff
Herbert P. Schweizer, RoxAnn R. Karkhoff-Schweizer

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésLac repressorComplementationPlasmidlac operonRepressorBiologyEscherichia coliPromoterGeneticsExpression vectorGeneOverproductionVector (molecular biology)Molecular biologyRecombinant DNAGene expressionPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since introduction of the first pUC plasmids ( 1 ), a great variety of plasmid vectors that use α-complementation and expression from the lac promoter, or its derivatives tac and trc promoters, have been developed (e.g., see refs. 2 – 14 ). In order to maximize utilization of these vectors, various Escherichia coli host strains have been designed which contain the lacZ ΔM15 allele ( 15 ) necessary for α-complementation and the lacI q ( 16 , 17 ) gene, which allows for overproduction of the lac repressor that is required for regulated expression from the lac promoter. The development of F episomes ( 7 , 14 , 18 ) or phages ( 1 , 19 ) containing these components facilitated the construction of various host strains, provided they do not express β-galactosidase (e.g., Δ lac strains). However, these systems suffer from several short-comings that restrict their use: Unless the episomes contain transposon-encoded antibiotic resistance markers (usually kanamycin or tetracycline), which also excludes their use in Tn 5 - or Tn 10 -containing strains, other commonly used F episomes require minimal medium for their maintenance because passage in rich media leads to their frequent loss ( 20 ), Since the episomes and phages have been tailored for use in E. coli , they cannot be exploited for establishment of a lac -based α-complementation and regulated expression system in other bacteria. These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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