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Enregistrement W2403313348 · doi:10.1385/1-59259-397-6:491

Yeast as a Host to Screen for Modulators and Regulatory Regions of Mammalian Protein Kinase C Isoforms

2003· article· en· W2403313348 sur OpenAlexafffund
Amadeo M. Parissenti, Heimo Riedel

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensLaurentian University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteHealth Canada
Mots-clésProtein kinase CSaccharomyces cerevisiaeSchizosaccharomyces pombeYeastGene isoformBiologyMutagenesisBiochemistryCell biologyComplementary DNAMutantKinaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of various mammalian protein kinase C (PKC) isoforms in yeast including Saccharomyces cerevisiae and Schizosaccharomyces pombe results in phenotypic changes such as substantial increases in the cell doubling time, alterations in cell morphology, enhanced production of cytoplasmic vesicles, and elevated uptake of external Ca2+. These phenotypes are the consequence of mammalian PKC catalytic activity. They require the expression of a mammalian PKC isoform, its proper domain structure including a functional catalytic domain, and typically activators such as phorbol esters. The observed phenotype is proportional to mammalian PKC catalytic activity and can be easily evaluated by observing the yeast cell doubling time. As a result, mammalian PKC activation by cell membrane-permeable activators such as tumor promoting phorbol esters, co-expressed protein ligands, or changes in PKC structure such as by random cDNA mutagenesis can be estimated through the resulting yeast colony size on agar plates or yeast culture density on microtiter plates. In this chapter, yeast is introduced as a host to screen libraries of PKC mutants, pharmacologic compounds, or PKC-binding proteins, for their impact on PKC catalytic activity. These libraries may originate from natural or synthetic pools of reagents or random cDNA mutagenesis strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,601

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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