Domain Selection in Metallothionein 1A: Affinity-Controlled Mechanisms of Zinc Binding and Cadmium Exchange
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian metallothioneins (MTs) are small, metal binding proteins implicated in cellular metal ion homeostasis and heavy metal detoxification. Divalent, metal-saturated MTs form two distinct domains; the N-terminal β domain binds three metals using nine Cys residues, and the C-terminal α domain binds four metals with 11 Cys residues. Domain selection during zinc binding and cadmium exchange to human MT1A was examined using a series of competition reactions with mixtures of the isolated domain fragments. These experiments were conducted at two biologically significant pH conditions where MTs exist in vivo. Neither zinc binding nor cadmium exchange showed any significant degree of specificity or selectivity based on detailed analysis of electrospray ionization mass spectrometric and circular dichroic data. Under acidic conditions, zinc binding and cadmium exchange showed slight α domain selectivity because of the increased preference for cooperative clustering of the α domain. Modeling of the reactions showed that at both physiological (7.4) and acidic (5.8) pHs, zinc binding and cadmium exchanges occur essentially randomly between the two fragments. The metal binding affinity distributions between the domain fragments are comingled and not significantly separated as required for a domain specific mechanism. The models show rather that the order of the binding events follows the order of the binding affinities that are distributed across both domains and that this can be considered quantitatively by the KF(Cd)/KF(Zn) binding constant ratio for each metal bound.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».