Activating the NLRP3 Inflammasome Using the Amyloidogenic Peptide IAPP
Notice bibliographique
Résumé
In addition to several other extracellular substances, phagocytosis of amyloid-forming peptides can perturb cellular homeostasis, leading to activation of the cytoplasmic innate immune receptor NLRP3. Once triggered, NLRP3 forms an inflammasome complex that ultimately cleaves pro-IL-1β and pro-IL-18 into their mature, secreted forms. Here we describe a protocol by which one type of amyloidogenic peptide, islet amyloid polypeptide (IAPP, otherwise known as amylin) can be prepared and used to stimulate myeloid cells in vitro to engage the NLRP3 inflammasome. Methods for measuring the ensuing inflammasome activation are also described. Although initially soluble, IAPP monomers rapidly aggregate in solution to form oligomers and subsequently insoluble amyloid fibrils. More work is required to examine how this transition influences inflammasome activation for different types of amyloid. The course of amyloid formation and corresponding inflammatory capacity of these pre-fibrillar species following uptake also requires further examination, and we hope that our protocols are useful in these endeavors. While these protocols are restricted to examination of synthetic IAPP, isolation of IAPP aggregates from human and transgenic mouse pancreas will be required to definitively determine the proinflammatory effects of endogenous IAPP oligomers and fibrils.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».