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Genomic Alterations in Cell-Free DNA and Enzalutamide Resistance in Castration-Resistant Prostate Cancer

2016· article· en· 384 citations· W2403998898 sur OpenAlex· 10.1001/jamaoncol.2016.0494

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates
aucune
Catégories consensuelles
aucune
Domaine
Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude
Signal candidat: ObservationnelSignal consensuel: aucune
Genre
Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants
0,754
Score d'incertitude au seuil
0,982
Statut de validation
machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants
0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

IMPORTANCE: The molecular landscape underpinning response to the androgen receptor (AR) antagonist enzalutamide in patients with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) is undefined. Consequently, there is an urgent need for practical biomarkers to guide therapy selection and elucidate resistance. Although tissue biopsies are impractical to perform routinely in the majority of patients with mCRPC, the analysis of plasma cell-free DNA (cfDNA) has recently emerged as a minimally invasive method to explore tumor characteristics. OBJECTIVE: To reveal genomic characteristics from cfDNA associated with clinical outcomes during enzalutamide treatment. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Plasma samples were obtained from August 4, 2013, to July 31, 2015, at a single academic institution (British Columbia Cancer Agency) from 65 patients with mCRPC. We collected temporal plasma samples (at baseline, 12 weeks, end of treatment) for circulating cfDNA and performed array comparative genomic hybridization copy number profiling and deep AR gene sequencing. Samples collected at end of treatment were also subjected to targeted sequencing of 19 prostate cancer-associated genes. EXPOSURE: Enzalutamide, 160 mg, daily orally. MAIN OUTCOMES AND MEASURES: Prostate-specific antigen response rate (decline ≥50% from baseline confirmed ≥3 weeks later). Radiographic (as per Prostate Cancer Working Group 2 Criteria) and/or clinical progression (defined as worsening disease-related symptoms necessitating a change in anticancer therapy and/or deterioration in Eastern Cooperative Group performance status ≥2 levels). RESULTS: The 65 patients had a median (interquartile range) age of 74 (68-79) years. Prostate-specific antigen response rate to enzalutamide treatment was 38% (25 of 65), while median clinical/radiographic progression-free survival was 3.5 (95% CI, 2.1-5.0) months. Cell-free DNA was isolated from 122 of 125 plasma samples, and targeted sequencing was successful in 119 of 122. AR mutations and/or copy number alterations were robustly detected in 48% (31 of 65) and 60% (18 of 30) of baseline and progression samples, respectively. Detection of AR amplification, heavily mutated AR (≥2 mutations), and RB1 loss were associated with worse progression-free survival, with hazard ratios of 2.92 (95% CI, 1.59-5.37), 3.94 (95% CI, 1.46-10.64), and 4.46 (95% CI, 2.28-8.74), respectively. AR mutations exhibited clonal selection during treatment, including an increase in glucocorticoid-sensitive AR L702H and promiscuous AR T878A in patients with prior abiraterone treatment. At the time of progression, cfDNA sequencing revealed mutations or copy number changes in all patients tested, including clinically actionable alterations in DNA damage repair genes and PI3K pathway genes, and a high frequency (4 of 14) of activating CTNNB1 mutations. CONCLUSIONS AND RELEVANCE: Clinically informative genomic profiling of cfDNA was feasible in nearly all patients with mCRPC and can provide important insights into enzalutamide response and resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
JAMA Oncology
Thématique
Prostate Cancer Treatment and Research
Domaine
Medicine
Établissements canadiens
BC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnaires
National Cancer Institute
Mots-clés
EnzalutamideProstate cancerMedicineInterquartile rangeOncologyInternal medicineCell-free fetal DNAProstate-specific antigenCancerAndrogen deprivation therapyAndrogen receptorBiologyGenetics
Résumé présent dans OpenAlex
oui