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Enregistrement W2406009869 · doi:10.1242/jcs.114.9.1731

RNA anchoring in the vegetal cortex of the <i>Xenopus</i> oocyte

2001· article· en· W2406009869 sur OpenAlexaff
Vernadeth B. Alarcón, Richard P. Elinson

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyXenopusMicrofilamentCell biologyMolecular biologyOocyteActinPhalloidinCytoskeletonGeneticsEmbryoCellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The body plan of the embryo is established by a polarized source of developmental information in the oocyte. The Xenopus laevis oocyte creates polarity by anchoring mRNAs in the vegetal cortex, including Vg1 and Xwnt-11, which might function in body plan specification, and Xcat-2, which might function in germ cell development. To identify components of the RNA anchoring mechanism, we used the manually isolated vegetal cortex (IVC) to assay loss or change in spatial arrangement of mRNAs caused by disruption of cortical elements. The role of cytoskeleton in mRNA anchoring was tested by treating oocytes with inhibitors that selectively disrupted actin microfilaments and cytokeratin filaments. Treatment of oocytes with cytochalasin B caused clumping of Vg1 and Xwnt-11 as revealed by in situ hybridization of the IVC, but did not cause their release, as confirmed by RT-PCR analysis. These mRNA clumps did not match the distribution of actin microfilament clumps, but were distributed similarly to the remnant cytokeratin filaments. Treatment of oocytes with monoclonal anti-cytokeratin antibody C11 released these mRNAs from the cortex. C11 altered the texture of the cytokeratin network, but did not affect the actin meshwork. These results show that Vg1 and Xwnt-11 are retained by a cytokeratin filament-dependent mechanism, and that organization of the cytokeratin network depend on an intact actin meshwork. Colcemid did not disrupt Vg1 and Xwnt-11 retention in the IVC, so anchoring of these mRNAs are independent of microtubules. Membrane disruption in the IVC by Triton X-100 decreased Vg1 and Xwnt-11. Loss of these mRNAs was due mainly to ribonuclease activity released from membrane components. However, when ribonuclease activity was suppressed under cold temperature, a higher amount of Vg1 and Xwnt-11 was recovered in the supernatant. This result suggested that a fraction of these mRNAs required membranes to be retained in the cortex. By contrast, Xcat-2 mRNA was neither released nor degraded following treatments with cytochalasin B, C11, colcemid and Triton X-100 under cold temperature, so no cortical element could be implicated in its anchoring.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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