MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2409599897 · doi:10.1002/art.39560

X Chromosome Dose and Sex Bias in Autoimmune Diseases: Increased Prevalence of 47,XXX in Systemic Lupus Erythematosus and Sjögren's Syndrome

2015· article· en· W2409599897 sur OpenAlexafffund
Ke Liu, Biji T. Kurien, Sarah Zimmerman, Kenneth M. Kaufman, Diana H. Taft, Leah C. Kottyan, Sara Lázaro, Carrie A. Weaver, John A. Ice, Adam J. Adler, James Chodosh, Lida Radfar, Astrid Rasmussen, Donald U. Stone, David M. Lewis, Shibo Li, Kristi A. Koelsch, Ann Igoe, Mitali Talsania, Jay Kumar, Jacen S. Maier‐Moore, Valerie M. Harris, Rajaram Gopalakrishnan, Roland Jonsson, James Lessard, Xianglan Lu, Jacques‐Eric Gottenberg, Juan‐Manuel Anaya, Deborah S. Cunninghame‐Graham, Andrew Huang, Michael T. Brennan, Pamela Hughes, Gabor G. Illei, Corinne Miceli‐Richard, Edward Keystone, Vivian P. Bykerk, Gideon M. Hirschfield, Gang Xie, Wan‐Fai Ng, Gunnel Nordmark, Per Eriksson, Roald Omdal, Nelson L. Rhodus, Maureen Rischmueller, Michael D. Rohrer, Barbara Segal, Timothy J. Vyse, Marie Wahren‐Herlenius, Torsten Witte, Bernardo A. Pons‐Estel, Marta E. Alarcón‐Riquelme, Joel M. Guthridge, Judith A. James, Christopher J. Lessard, Jennifer A. Kelly, Susan D. Thompson, Patrick M. Gaffney, Courtney G. Montgomery, Jeffrey C. Edberg, Robert P. Kimberly, Graciela S. Alarcón, Carl Langefeld, Gary S. Gilkeson, Diane L. Kamen, Betty P. Tsao, W. Joseph McCune, Jane E. Salmon, Joan T. Merrill, Michael H. Weisman, Daniel J. Wallace, Tammy O. Utset, Erwin P. Böttinger, Christopher I. Amos, Katherine A. Siminovitch, Xavier Mariette, Kathy L. Sivils, John B. Harley, R. Hal Scofield

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensAmgen (Canada)Toronto General HospitalUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteInstituto de Salud Carlos IIINational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilCanada Research ChairsCollege of Medicine, University of OklahomaNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of OklahomaArthritis AustraliaLupus Research AllianceAlliance for Lupus ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftResearch to Prevent BlindnessU.S. Department of Veterans AffairsU.S. Department of Defense
Mots-clésMedicineOdds ratioRheumatoid arthritisConfidence intervalInternal medicinePrimary biliary cirrhosisGastroenterologyTrisomyAutoimmune diseaseImmunologyDiseaseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: More than 80% of autoimmune disease predominantly affects females, but the mechanism for this female bias is poorly understood. We suspected that an X chromosome dose effect accounts for this, and we undertook this study to test our hypothesis that trisomy X (47,XXX; occurring in ∼1 in 1,000 live female births) would be increased in patients with female-predominant diseases (systemic lupus erythematosus [SLE], primary Sjögren's syndrome [SS], primary biliary cirrhosis, and rheumatoid arthritis [RA]) compared to patients with diseases without female predominance (sarcoidosis) and compared to controls. METHODS: All subjects in this study were female. We identified subjects with 47,XXX using aggregate data from single-nucleotide polymorphism arrays, and, when possible, we confirmed the presence of 47,XXX using fluorescence in situ hybridization or quantitative polymerase chain reaction. RESULTS: We found 47,XXX in 7 of 2,826 SLE patients and in 3 of 1,033 SS patients, but in only 2 of 7,074 controls (odds ratio in the SLE and primary SS groups 8.78 [95% confidence interval 1.67-86.79], P = 0.003 and odds ratio 10.29 [95% confidence interval 1.18-123.47], P = 0.02, respectively). One in 404 women with SLE and 1 in 344 women with SS had 47,XXX. There was an excess of 47,XXX among SLE and SS patients. CONCLUSION: The estimated prevalence of SLE and SS in women with 47,XXX was ∼2.5 and ∼2.9 times higher, respectively, than that in women with 46,XX and ∼25 and ∼41 times higher, respectively, than that in men with 46,XY. No statistically significant increase of 47,XXX was observed in other female-biased diseases (primary biliary cirrhosis or RA), supporting the idea of multiple pathways to sex bias in autoimmunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations174
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArthritis & RheumatologyMême sujetGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal AbnormalitiesTravaux en français237 207