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Enregistrement W2412642891 · doi:10.1182/blood.v122.21.2670.2670

Zebrafish Xenotransplantation and Focused Chemical Genomics: A Preclinical Therapeutic Model For T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia

2013· article· en· W2412642891 sur OpenAlexaff
Victoria L. Bentley, Chansey J. Veinotte, Dale Corkery, Marissa A. LeBlanc, Karen Bedard, Andrew P. Weng, Graham Dellaire, Jason N. Berman

Notice bibliographique

RevueBlood · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensBC Cancer AgencyIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishBiologyXenotransplantationCancer researchPTENLeukemiaT cellMolecular biologyIn vivoPI3K/AKT/mTOR pathwayImmune systemImmunologyTransplantationCell biologyGeneticsSignal transductionGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is a high-risk subset of ALL, for which there is a need for new therapeutic strategies and efficient preclinical screening methods. We have pioneered an innovative zebrafish human cancer xenotransplantation (XT) model to examine drug-tumor interactions in vivo. T-ALL cell lines and primary patient T-ALL samples were microinjected into 48-hour zebrafish embryos, a stage at which the adaptive immune system has not yet developed. Fluorescent labelling of tumor cells prior to injection and use of casper pigment mutant fish facilitates evaluation of drug response both by direct observation in transparent fish and enumeration of human cells following embryo dissociation. Proliferation rates are rapidly determined by directly counting fluorescent cells using in silico-based programs and/or utilizing immunohistochemical approaches to distinguish human cancer cells from host cell populations. T-ALL cell lines harboring defined mutations in the NOTCH1, phosphoinositide 3-kinase (PI3K)/AKT and mTOR pathways differentially responded to targeted inhibition using the γ-secretase inhibitor Compound E, triciribine, and rapamycin, when xenografted into embryos, consistent with responses in vitro. Primary patient-derived T-ALL bone marrow samples similarly engrafted and proliferated in zebrafish embryos. Using this in vivo chemical genomic approach, a targetable mutation sensitive to γ-secretase inhibition was identified from the diagnostic bone marrow sample of a child with T-ALL, which was confirmed by exome Sanger sequencing, and validated as a gain-of-function mutation in the NOTCH1 gene by luciferase assay and Western blot. Focused chemical genomics using the zebrafish T-ALL XT model provides a means of tailoring therapy using a real time in vivo assay that more accurately recapitulates the tumor microenvironment than in vitro methods and more rapidly than mouse xenografts. Moreover, the efficiency and cost-effectiveness of this innovative platform provides a novel intermediary for the prioritization of much-needed drug candidates in the preclinical pipeline. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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