[Associations of Crohn's disease with DR4 and DR5 gene polymorphisms].
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To assess the associations of death receptor DR4 and DR5 gene polymorphisms with Crohn's disease (CD). METHODS: A total of 295 CD patients and 490 healthy controls were recruited. Three single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the DR4 (rs13278062, rs20575) and DR5 (rs1047266) genes were determined with a SNaPshot method. Unconditional logistic regression analysis was carried out for determining the allelic and genotypic differences of the three SNPs between CD patients and the controls, as well as the influence of the DR4 and DR5 gene polymorphisms on the clinical features of CD patients. Linkage disequilibrium and haplotype analysis were calculated by haplotype 4.2 and R language software. A gene-gene interaction model was established to analyze whether the three SNPs can exert a synergistic effect on the susceptibility to CD. RESULTS: The mutant allele (T) and genotype (GT+TT) of DR4 (rs13278062) were increased among CD patients compared to the controls (37.12% vs. 32.04%, P = 0.040, 95%CI: 1.010-1.550; 62.71% vs. 54.90%, P = 0.032, 95%CI: 1.028-1.855, respectively). However, the allelic and genotypic frequencies of DR4 (rs20575) and DR5 (rs1047266) did not differ between the two groups (all P > 0.05). Based on the Montreal Classification Standards, the CD patients were stratified by locations and behaviors of the disease. After multiple comparison correction (P < 0.0125), compared to ileocolonic CD patients respectively, the mutant allele (T) and genotype (GT+TT) of the rs13278062 polymorphism were significantly increased in colonic CD patients (41.04% vs. 25.64%, P = 0.002, 95%CI: 0.315-0.778; 66.04% vs. 41.03%, P = 0.001, 95%CI: 0.196-0.655, respectively) and terminal ileum CD patients (41.44% vs. 25.64%, P = 0.002, 95%CI: 0.311-0.762; 74.77% vs. 41.03%, P < 0.001, 95%CI: 0.126-0.437, respectively). In comparison to penetrating CD patients, the mutant allele (T) and genotype (GT+TT) of DR4 (rs13278062) were significantly decreased in stricturing CD patients (32.29% vs. 48.91%, P = 0.007, 95%CI: 0.300-0.828; 57.29% vs. 86.96%, P = 0.001, 95%CI: 0.078-0.520, respectively). A similar conclusion was drawn for the mutant genotype (GT+TT) of DR4 (rs13278062) in non-stricturing, non-penetrating CD patients (58.82% vs. 86.96%, P = 0.001, 95%CI: 0.086-0.536). Haplotype analysis indicated that the CT haplotype formed by rs20575 and rs13278062 was increased in CD patients compared to the controls (37.1% vs. 31.8%, P = 0.029, OR=1.279, 95%CI: 1.022-1.600). The outcome of a gene-gene interaction model indicated that the mutant genotype (GT+TT) of DR4 (rs13278062) and mutant genotype (CT+TT) of DR5 (rs1047266) may play a negatively synergistic role in CD patients (B = - 0.483, OR = 0.617, P = 0.030). CONCLUSION: The rs13278062 polymorphism of the DR4 gene not only can confer an increased risk for CD, but may also influence the location of the lesions and the disease behaviors. The CT haplotype formed by rs20575 and rs13278062 may be an independent risk factor for CD. Furthermore, the mutant genotype (GT+TT) of DR4 (rs13278062) and mutant genotype (CT+TT) of DR5 (rs1047266) may exert a negative synergistic effect on CD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».