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Enregistrement W2412976564 · doi:10.1021/acs.cgd.5b00995

Quantitative Analysis of the Efficacy and Potency of Novel Small Molecule Ice Recrystallization Inhibitors

2015· article· en· W2412976564 sur OpenAlexafffund
Stephanie Abraham, Kerkeslin Keillor, Chantelle J. Capicciotti, G. Evan Perley-Robertson, Jeffrey W. Keillor, Robert N. Ben

Notice bibliographique

RevueCrystal Growth & Design · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
Thématiquenanoparticles nucleation surface interactions
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Blood Services
Mots-clésRecrystallization (geology)PotencyChemistryMoleculeSmall moleculeStereochemistryCrystallographyBiochemistryOrganic chemistryIn vitroGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The effects of ice recrystallization are well-recognized throughout the literature. This phenomenon is the major cause for cellular damage during thawing of cells, ultimately reducing post-thaw viability and function. In this paper, we describe a method for quantifying the inhibitory effect on ice recrystallization of novel small molecules that are cryoprotectants for red blood cells. The method is ideally suited to the splat-cooling assay, where high-ice volume fractions are present. Using our method, we have derived first-order rate constants for the increase in the average crystal size based upon a “binning” approach of ice crystals as a function of size and time. Using this reliable metric, dose–response curves were constructed to obtain IC 50 values. Two very effective inhibitors of ice recrystallization, p -methoxyphenyl β- d -glucopyranoside (PMP-Glc) and p -bromophenyl β- d -glucopyranoside (pBrPh-Glc), had IC 50 values of 16.3 and 14.8 mM, respectively. Interestingly, the Hill slopes from these dose–response curves were 5.12 ± 0.81 for PMP-Glc and 3.12 ± 0.62 for pBrPh-Glc, suggesting that an element of cooperativity may be involved in the mechanism by which these compounds inhibit ice recrystallization. This is particularly interesting, as unlike antifreeze (glyco)proteins, these small molecules do not bind to the ice surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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