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Enregistrement W2413758964 · doi:10.1093/neuonc/nov236.10

TMIC-10PLEIOTROPY OF TUMOR-ASSOCIATED MYELOID CELLS WITHIN HUMAN GLIOBLASTOMA

2015· article· en· W2413758964 sur OpenAlexaff
Konrad Gabrusiewicz, Jun Wei, Yuuri Hashimoto, Benjamin A.T. Rodriguez, Maiti Sourindra, Brandon Liebelt, Luke M. Healy, Roeland Verhaak, Raversanker Ezhilarasan, Shouhao Zhou, Neal Huang, Jefffrey Weinberg, Sujit S. Prabhu, Ganesh Rao, Raymond Sawaya, Frederick F. Lang, Erik P. Sulman, Laurence J.N. Cooper, Jack P. Antel, Amy B. Heimberger

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlioblastomaTumor cellsMyeloid cellsMyeloidMyeloid leukemiaCancer researchMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: GBM is highly infiltrated by diverse immune cells including microglia, monocyte-derived macrophages, and myeloid-derived suppressor cells (MDSCs). Understanding the mechanisms through which glioblastoma-associated myeloid cells (GAMs) undergo a metamorphosis into tumor supportive cells, characterizing the heterogeneity of immune cell phenotypes within GBM subtypes and discovering new targets can help to design new efficient immunotherapies against GBM. METHODS: GAMs were isolated from GBMs by immunomagnetic separation (n = 17) and microglia were identified as CD11b+CD45low, MDSCs as CD11b+CD33+CD45med, and macrophages as CD11b+CD45high. Whole genome microarray analysis (30,275 human genes) was performed using RNA isolated from the GAMs and matched blood monocytes. Comparisons were also made between GAMs and healthy donor monocytes (n = 11), normal adult human brain microglia (n = 9), and normal human CD14+ monocytes polarized into the M0, M1, M2a, and M2c phenotype (n = 5) using flow cytometry, and gene/microRNA expression profiling. RESULTS: GBM patients had elevated monocytes relative to normal donors. Among CD11b+ cells, microglia and MDSCs constituted a higher percentage of GBM-infiltrating immune cells compared to macrophages. GAM profiling revealed a continuum between anti-tumor pro-inflammatory M1- (MHC II, CD80, CD86, p-STAT1, TNF-α) and tumor-supportive M2-like (CD163, CD206, p-STAT3, TGF-β1, IL-10) myeloid cells, with immune functional assays indicating greater alignment with M2. Flow cytometry studies and gene expression analysis demonstrated, that M1-and M2-polarized macrophages expressed a unique mixed M1/M2 phenotype. GAMs and GBM patient blood monocytes showed distinct immunological functions with the former aligned closer to an M2 phenotype that seemed to play a crucial role in GBM invasiveness and progression. CONCLUSIONS: Within GBM, microglia and MDSCs constitute the majority of tumor-infiltrating myeloid cells that express genes within the continuum of M1/M2 with alignment favoring M2 indicating GAMs have pleiotropic immunological functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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