Notice bibliographique
Résumé
The covalent modification of cell proteins by the attachment of myristic acid, a 14 carbon saturated fatty acid, to their N-terminal amino acid is now recognized to be a widespread phenomenon ( 1 – 5 ). The enzyme responsible for the attachment of myristic acid to these proteins is myristoyl-CoA: Protein N -myristoyltransferase (NMT; EC 2.3.1.97). This enzyme catalyzes the transfer of myristic acid from myristoyl-CoA to the N-terminal amino acid of the target protein and results in the fatty acid being amide-bonded to the α-amino group of the amino acid. Because this transfer is susceptible to protein synthesis inhibitors, it must take place as the protein is synthesized ( 6 , 7 ). Data from the studies on both the sequence of known myristoylated proteins, and from those on the sequence requirements for NMT, suggests that the N-terminal amino acid is always a glycine residue ( 5 ). However the other sequence requirements for protein N-myristoylation are less certain and the resulting vague general consensus sequence is summarized in Fig. 1 . Although the majority of proteins that are substrates for NMT are myristoylated, the enzyme can make use of a limited range of other fatty acids, including shorter-chain and unsaturated fatty acids. In general, this occurs when these fatty acids form the majority of the acyl-CoA pool in a cell or tissue, for example, in the retina ( 8 ). For most practical purposes, however, NMT can be regarded as essentially specific for myristic acid. Permitted sequences for N-terminal myristoylation by mammalian NMT. The single-letter nomenclature for the amino acids has been used, and the permitted residues are based on the sequences of known myristoyl-proteins, as described by Rudnick et al. ( 5 ). The glycine at position 1 is obligatory. Serine is the most common amino acid found at position 5, and increases the affinity of yeast NMT for substrate peptides, but other amino acids are found here in mammalian myristoyl-proteins. Proline has not yet been found at position 6, nor have tryptophan or tyrosine been found at positions 7 and 8. Generally, acidic residues are not found at position 4. These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».