The many faces of alpha synuclein: from phospholipid bilayer interactions to amyloid aggregation
Notice bibliographique
Résumé
Alpha synuclein (αS) is a ~14 kDa intrinsically disordered protein with a yet unknown physiological function. The conversion of monomeric αS into amyloid aggregates is believed to play a central role of the pathology of Parkinson’s disease (PD). Despite extensive studies on amyloid formation of αS in bulk solution, the mechanistic details of αS aggregation at biological interfaces like lipid membranes are unclear. Further, it is also unknown how amyloid aggregates that are formed in PD potentiate neuronal cell death. Association with (specific) cellular membranes is believed facilitate amyloid formation, but this hypothesis is clouded by the fact that the physiological function of αS probably also involves association with physiological cell membranes. Therefore, understanding interactions of αS with lipid membranes is critical to uncover its possible functional or pathological role, which we have investigated in this thesis. In particular, we focus on the following questions which form the core of the thesis: * How are physical properties of phospholipid membranes affected by αS binding and aggregation and vice versa? * How do early amyloid aggregates of αS perturb phospholipid membranes? * What is the role of N-terminal acetylation in αS on its membrane binding properties and aggregation propensities? * How do terminal domains in αS affect the morphology of amyloid aggregates? To answer these questions a wide range of biochemical and biophysical techniques like fluorescence confocal microscopy, fluorescence anisotropy, circular dichroism, Fourier transform infra-red spectroscopy and fluorescence recovery after photobleaching were used to probe the interactions of lipid membranes with monomeric αS. Our results show the importance of inter-αS, inter-lipid and αS–lipid interactions that are involved both prior to and post amyloid formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».