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Enregistrement W2418163513 · doi:10.1038/srep22066

Pygo2 functions as a prognostic factor for glioma due to its up-regulation of H3K4me3 and promotion of MLL1/MLL2 complex recruitment

2016· article· en· W2418163513 sur OpenAlexaff
Cefan Zhou, Yi Zhang, Jun Dai, Mengzhou Zhou, Miao Liu, Yefu Wang, Xing‐Zhen Chen, Jingfeng Tang

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesHubei UniversityHubei University of Technology
Mots-clésWnt signaling pathwayH3K4me3BiologyCancer researchGliomaHistoneEpigeneticsBioinformaticsSignal transductionCell biologyGeneticsPromoterGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pygo2 has been discovered as an important Wnt signaling component contributing to the activation of Wnt-target gene transcription. In the present study, we discovered that Pygo2 mRNA and protein levels were up-regulated in the majority of (152/209) human brain glioma tissues and five glioma cell lines, and significantly correlated with the age, the WHO tumor classification and poor patient survival. The histone methyltransferase complex components (WDR5, Ash2, and menin, but not CXCC1 or NCOA6) were down-regulated at the promoter loci of Wnt target genes after Pygo2 knockdown, and this was accompanied by the down-regulation of Wnt/β-catenin pathway activity. Further, we demonstrated that the involvement of Pygo2 in the activation of the Wnt pathway in human glioma progression is through up-regulation of the H3K4me3 (but not H3K4me2) by promoting the recruitment of the histone methyltransferase MLL1/MLL2 complex to Wnt target gene promoters. Thus, our study provided evidence that Pygo2 functions as a novel prognostic marker and represents a potential therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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