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Enregistrement W2419532052 · doi:10.1002/psc.2884

Site‐specific conjugation of the quencher on peptide's N‐terminal for the synthesis of a targeted non‐spreading activatable optical probe

2016· article· en· W2419532052 sur OpenAlexafffund
Bryan Simard, Gleb G. Mironov, Bogusław Tomanek, Frank C. J. M. van Veggel, Abedelnasser Abulrob

Notice bibliographique

RevueJournal of Peptide Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueClick Chemistry and Applications
Établissements canadiensNational Research Council CanadaUniversity of VictoriaUniversity of AlbertaIONICS Mass Spectrometry (Canada)University of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCarbodiimideConjugateChemistryPeptideFluorescenceCombinatorial chemistryYield (engineering)BioconjugationProtecting groupLysineAmino acidStereochemistryBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Optical imaging offers high sensitivity and portability at low cost. The design of 'smart' or 'activatable' probes can decrease the background noise and increase the specificity of the signal. By conjugating a fluorescent dye and a compatible quencher on each side of an enzyme's substrate, the signal remains in its 'off ' state until it reaches the area where a specific enzyme is expressed. However, the signal can leak from that area unless the dye is attached to a molecule able to bind to a specific target also presented in that area. The aim of this study was to (i) specifically conjugate the quencher on the α-amino group of the peptide's N-terminus, (ii) conjugate the dye on the ε-amino group of a lysine in C-terminus, and (iii) conjugate the carboxyl group of the peptide's C-terminus to an amino group present on an antibody, using carbodiimide chemistry. The use of protecting groups, such as Boc or Fmoc, to allow site-specific conjugation, presents several drawbacks including 'on beads labeling', additional steps required for deprotection and removal from the resin, decreased yield, and dye degradation. A method of preferential labeling of α-amino N-terminal group in slightly acidic solution, proposed by Selo et al. (1996) has partially solved the problem. The present study reports improvements of the method allowing to (i) avoid the homo-bilabeling, (ii) increase the yield of the N-terminal labeling by two folds, and (iii) decrease the cost by 44-fold. Copyright © 2016 European Peptide Society and John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,266

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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