MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2421289519 · doi:10.4238/gmr.15028579

Altered expression of CG5961, a putative Drosophila melanogaster homologue of FBXO9, provides a new model of Parkinson disease

2016· article· en· W2421289519 sur OpenAlexafffund
Eric M. Merzetti, Brian E. Staveley

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMemorial University of Newfoundland
Mots-clésDrosophila melanogasterBiologyGeneGeneticsMelanogasterRNA interferenceNeurodegenerationGene expressionDopaminergicCell biologyNeuroscienceDiseaseRNADopaminePathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

F-box proteins act as the protein recognition component of the Skp-Cul-F-box class of ubiquitin ligases. Two members of a gene sub-family encoding these proteins, FBXO7 and FBXO32, have been implicated in the onset and progression of degenerative disease. FBXO7 is responsible for rare genetic forms of Parkinson disease, while FBXO32 has been implicated in muscle wasting. The third gene in this family, FBXO9, is related to growth signaling, but the role of this gene in degenerative disease pathways has not been thoroughly investigated. Characterizing the putative Drosophila melanogaster homologue of this gene, CG5961, enables modeling and analysis of the consequence of targeted alteration of gene function and the effects on the overall health of the organism. Comparison of the protein domains of Homo sapiens FBXO9 and the putative D. melanogaster homologue CG5961 revealed a high degree of conservation between the protein domains. Directed expression of CG5961 (via CG5961(EP)) and inhibition of CG5961 (through a stable RNAi transgene) in the developing D. melanogaster eye caused abnormalities in adult structures (ommatidia and inter-ommatidial bristles). Directed expression of either CG5961 or CG5961-RNAi in the dopaminergic neurons led to a reduced lifespan compared to that in lacZ controls. We showed that protein structures of CG5961 and FBXO9 are highly similar and studied the effects of altered expression of CG5961 in neuron-rich tissues. Our results suggest that CG5961 activity is necessary for the proper formation of neuronal tissue and that targeted alteration of gene expression in dopaminergic neurons leads to a reduced lifespan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenetics and Molecular ResearchMême sujetUbiquitin and proteasome pathwaysTravaux en français237 207