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Enregistrement W2430190007 · doi:10.1385/1-59259-184-1:205

Cadmium-113 and Lead-207 NMR Spectroscopic Studies of Calcium-Binding Proteins

2003· article· en· W2430190007 sur OpenAlexafffund
Teresa E. Clarke, Hans J. Vogel

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésChemistryCalciumCalcium-binding proteinBinding siteMetalloproteinIonMetalNuclear magnetic resonance spectroscopyCrystallographyCadmiumBiophysicsStereochemistryBiochemistryBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ideally, direct NMR spectroscopic studies of the structure and dynamics of a metal binding site would utilize the ion that is naturally bound to the protein. For calcium-binding proteins, the NMR active isotope 43 Ca is a quadrupolar (I = 7/2) nucleus that produces broad peaks when bound to a protein ( 1 – 4 ) Although much useful information can be gleaned from studies of this nucleus ( 3 , 4 ), it is impossible to resolve the signals for individual calcium-binding sites in a protein with multiple-binding sites. However, isomorphous replacement of the calcium ion with an ion with more favorable NMR properties often allows the resolution of NMR signals for individual sites and provides valuable insight into the coordination of the ion within the binding site from the observed shifts. 113 Cd, and to a lesser extent, 207 Pb, are two such I = 1/2 metal nuclei that have been successfully used to characterize the Ca 2+ -binding properties of a variety of metalloproteins ( 5 – 8 ) These keywords were added by machine and not by the authors. This process is experimental and the keywords may be updated as the learning algorithm improves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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