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Enregistrement W2433847111 · doi:10.1093/neuonc/now073.49

HG-53HYPERMUTATION AND NEOANTIGEN FORMATION PREDICT RESPONSE TO IMMUNE CHECKPOINT INHIBITION IN CHILDHOOD BIALLELIC MISMATCH REPAIR DEFICIENT GLIOBLASTOMA

2016· article· en· W2433847111 sur OpenAlexaff
Brittany Campbell, Éric Bouffet, Valérie Larouche, Gary Mason, Alyssa Reddy, Michael Osborn, Vanan Magimairan, Daniele Merico, Richard de Borja, Brian K. Chung, Melissa A. Galati, Melyssa Aronson, Carol Durno, Joerg Kruger, Vanja Cabric, Nataliya Zhukova, Vijay Ramaswamy, Roula Farah, Samina Afzal, Michal Yalon, Gideon Rechavi, Michael F. Walsh, Shlomi Constantini, Rina Dvir, Ronit Elhasid, Michael Sullivan, Jordan R. Hansford, Andrew Dodgshun, Nancy Klauber‐DeMore, Lindsay L. Peterson, Sunil J. Patel, Scott Lindhorst, Jeffrey Atkinson, Rachel Laframboise, Zane Cohen, Peter B. Dirks, Michael D. Taylor, David Malkin, Steffen Albrecht, Roy Dudley, Nada Jabado, Cynthia Hawkins, Adam Shlien, Uri Tabori

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiopharmaceutical Chemistry and Applications
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's HospitalIzaak Walton Killam Health CentreUniversity of ManitobaMount Sinai HospitalCancerCare ManitobaResearch Institute in Oncology and HematologySickKids FoundationUniversité LavalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlioblastomaDNA mismatch repairImmune systemMedicineCancer researchDNA repairImmunologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recurrent glioblastomas are universally lethal and common in the context of an aggressive cancer predisposition syndrome termed biallelic mismatch repair deficiency (bMMRD). bMMRD results in rapid onset of childhood cancers characterized by a high mutational burden. Evidence suggests that high mutation and neoantigen loads are associated with response to immune checkpoint inhibition (ICI). Exome sequencing and neoantigen prediction was performed on 37 bMMRD cancers and compared to childhood and adult neoplasms. Mutation and neoantigen load in bMMRD tumors were compared to adult melanomas, colorectal cancers and lung carcinomas that were responsive to ICIs. ICI were offered to bMMRD patients with recurrent tumors. bMMRD glioblastoma (n = 20) had significantly higher mutational load than sporadic pediatric and adult gliomas (p < 0.0001). bMMRD glioblastoma with secondary polymerase mutations had the highest mutation load (mean 17,740 + /-7703) in humans with mean neoantigen load 7-16 times higher than immunoresponsive adult tumors (p = 0.00001). Spatial and temporal sampling of individual bMMRD tumors revealed large variations in mutation and neoantigen landscape which is related to prior therapy. Based on these preclinical data, 6 bMMRD patients with recurrent glioblastoma are being treated with ICI with clinically significant and profound radiological responses. This report is the first to delineate the mutable nature of the neoantigen landscape in cancers where new mutations are constantly arising due to lack of replication repair. The encouraging responses of recurrent malignant brain tumors to immune checkpoint inhibition may have implications for other hypermutant cancers arising from primary (genetic predisposition) or secondary somatic mismatch repair deficiency

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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