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Enregistrement W2435135167 · doi:10.1093/neuonc/now075.02

LG-02MYB-QKI REARRANGEMENTS IN ANGIOCENTRIC GLIOMA DRIVE TUMORIGENICITY THROUGH A TRIPARTITE MECHANISM

2016· article· en· W2435135167 sur OpenAlex
Guillaume Bergthold, Pratiti Bandopadhayay, Lori Ramkissoon, Payal Jain, Jeremiah A. Wala, Steven E. Schumacher, Shakti Ramkissoon, Pascale Varlet, Mélanie Pagès, Matthew D. Ducar, Paul Van Hummelen, Daniel C. Bowers, Caterina Giannini, Stéphanie Puget, Cynthia Hawkins, Uri Tabori, Álmos Klekner, László Bognár, Peter C. Burger, Charles G. Eberhart, Fausto J. Rodríguez, D. Ashley Hill, Sabine Müller, Daphne A. Haas-Kogan, Joanna J. Phillips, Sandro Santagata, Charles D. Stiles, James E. Bradner, Nada Jabado, Alon Goren, Jacques Grill, Azra H. Ligon, Liliana Goumnerova, Angela J. Waanders, Philip B Storm, Mark W. Kieran, Adam Resnick, Keith L. Ligon, Rameen Beroukhim

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Mechanisms and Therapy
Établissements canadiensMcGill UniversityHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMechanism (biology)GliomaBiologyGeneticsPhilosophyEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Pediatric low-grade gliomas (PLGGs) are among the most common solid tumors in children, encompassing multiple histological subtypes of WHO Grade I and II gliomas. While BRAF mutations and MYBL1 rearrangements have recently been identified as oncogenic drivers in pediatric gangliogliomas and diffuse astrocytomas, respectively, the oncogenic drivers for the majority of diffuse PLGGs remain unknown. Angiocentric gliomas (AGs) are pediatric low-grade gliomas (PLGGs) without known recurrent genetic drivers. METHODS: Prior genomic studies were insufficiently powered to determine the true frequency of driver alterations in rare PLGG subtypes, to identify recurrent driver alterations that occur less frequently, or to associate specific alterations with specific histological subtypes. To address this, we performed a genomic analysis of the PLGG landscape by combining newly generated and previously published sequencing datasets. Our combined cohort included 249 PLGGs including 19 AGs. RESULTS: We identified MYB-QKI fusions as a specific and single candidate driver event in AGs. In vitro and in vivo functional studies show MYB-QKI rearrangements promote tumorigenesis through three mechanisms: expression of the oncogenic MYB-QKI fusion protein, H3K27ac enhancer translocation that contributes to aberrant MYB-QKI expression, and hemizygous loss of the tumor suppressor QKI that co-operates with MYB-QKI expression to promote cell proliferation. CONCLUSIONS: We have identified MYB-QKI fusions to be a specific and single candidate driver event in AGs. This finding has diagnostic and therapeutic significance. In addition, we present the first example of a single driver rearrangement simultaneously transforming cells via three genetic and epigenetic mechanisms in a cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,371
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle