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Enregistrement W2461485637 · doi:10.1186/s13717-016-0054-4

Invasion by Conyza sumatrensis alters soil microbial community structure in urban ecosystems

2016· article· en· W2461485637 sur OpenAlexfundno aff
Nazima Rasool, Zafar A. Reshi, Damase P. Khasa, Mudasir Roshan, Manzoor A. Shah

Notice bibliographique

RevueEcological Processes · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Bureau for International Education
Mots-clésBiologySpecies richnessTemperature gradient gel electrophoresisEcosystemEcology16S ribosomal RNABacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Whether invasive plants stimulate or inhibit the soil microbial diversity is still an open question. Despite large-scale invasion by Conyza sumatrensis (Retz.) E. Walker in the urban ecosystems of the Srinagar city of the Kashmir Himalayan region, limited information exists on its impact, particularly, on the belowground microbial diversity. The present study was thus conducted to compare the soil microbial (bacterial and ascomycetous fungal) diversity between the sites invaded by C. sumatrensis and un-invaded (control) sites. Soil metagenome was extracted from C. sumatrensis invaded and un-invaded plots at the three study sites. A total of six plots (5 × 5 m each in size), including three invaded by C. sumatrensis and three un-invaded plots were nested within each study site. DNA after amplification was subject to denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE); the bands were extracted from the DGGE gel, re-amplified, and sequenced for identification of the species. The number of bacterial species was reduced in the invaded plots at two out of the three sites while as it was relatively higher in the un-invaded plots with many species exclusively found in these plots. Fungal species richness was higher in the invaded plots compared to the un-invaded plots at all the three sites. Also, more fungal species were found to occur exclusively in the invaded plots without being represented in the un-invaded plots. Invasion by C. sumatrensis alters soil microbial community structure in the urban ecosystems in the Kashmir Himalaya. How this species does so and what benefits does it draw from such alteration promise to be an interesting future discourse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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