Subsets of salivary duct carcinoma defined by morphologic evidence of pleomorphic adenoma, <i>PLAG1</i> or <i>HMGA2</i> rearrangements, and common genetic alterations
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The authors hypothesized that histogenetic classification of salivary duct carcinoma (SDC) could account for de novo tumors and those with morphologic or molecular evidence (pleomorphic adenoma gene 1 [PLAG1], high-mobility group AT hook 2 [HMGA2] rearrangement, amplification) of pleomorphic adenoma (PA). METHODS: SDCs (n = 66) were reviewed for morphologic evidence of PA. PLAG1 and HMGA2 alterations were detected by fluorescence in situ hybridization (FISH). PLAG1-positive tumors were tested by FISH for fibroblast growth factor receptor 1 (FGFR1) rearrangement. Thirty-nine tumors were analyzed using a commercial panel for mutations and copy number variations in 50 cancer-related genes. RESULTS: On the basis of combined morphologic and molecular evidence of PA, 4 subsets of SDC emerged: 1) carcinomas with morphologic evidence of PA but intact PLAG1 and HMGA2 (n = 22); 2) carcinomas with PLAG1 alteration (n = 18) or 3) HMGA2 alteration (n = 12); and 4) de novo carcinomas, without morphologic or molecular evidence of PA (n = 14). The median disease-free survival was 37 months (95% confidence interval, 28.4-45.6 months). Disease-free survival and other clinicopathologic parameters did not differ for the subsets defined above. Combined Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog/phosphatidylinositol-4,5-biphosphate 3-kinase, catalytic subunit α (HRAS/PIK3CA) mutations were observed predominantly in de novo carcinomas (5 of 8 vs 2 of 31 tumors; P = .035). Erb-B2 receptor tyrosine kinase 2 (ERBB2) copy number gain was not observed in de novo carcinomas (0 of 8 vs 12 of 31 tumors; P = .08). Tumor protein 53 (TP53) mutations were more common in SDC ex pleomorphic adenomas than in de novo carcinomas (17 of 31 vs 1 of 8 tumors; P = .033). CONCLUSIONS: The genetic profile of SDC varies with the absence or presence of pre-existing PA and its cytogenetic signature. Most de novo SDCs harbor combined HRAS/PIK3CA mutations and no ERBB2 amplification. Cancer 2016;122:3136-44. © 2016 American Cancer Society.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle