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Enregistrement W2465842628 · doi:10.5897/ajb11.2096

Molecular cloning and characterization of the chalcone isomerase gene from sweetpotato

2011· article· en· W2465842628 sur OpenAlexaff
Zhang Zu-rong, Qiang Wei, Yufan Fu, Lingjiang Zeng, Liao Zhi-hua

Notice bibliographique

RevueAFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesChina Scholarship CouncilNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésChalcone isomeraseChalconeChalcone synthaseBiochemistryAnthocyaninGeneBiologyIsomeraseChemistryBiosynthesisBotanyStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anthocyanins are flavonoids and possess extensive bioactivities and pharmacological properties. Chalcone isomerase (CHI; EC 5.5.1.6) is an essential enzyme of the anthocyanins biosynthetic pathway, which catalyzes the intramolecular cyclization of bicyclic chalcones into tricyclic (S)-flavanones. In order to investigate the role of chalcone isomerase in anthocyanins biosynthesis in sweetpotato, we cloned and characterized the chalcone isomerase gene from purple-fleshed sweetpotato (Ipomoea batatas (L.) Lam) cultivar Yuzi 263, which was designated as IbCHI (Genbank accession number: JN083840). The full-length cDNA of IbCHI was 890-bp long and contained a 732-bp coding sequence encoding a polypeptide of 243-amino acids. A phylogenetic tree of CHIs was constructed from different organisms including plants and algae, which showed that IbCHI had high similarities with other plant CHIs. Tissue expression pattern analysis indicated that IbCHI was expressed constitutively in all sweetpotato tissues including roots, stems, young leaves, old leaves and petiole with highest expression in roots, and at the same time the anthocyanin content in the tissues coincided with the gene expression pattern. The cloning and characterization of IbCHI will be helpful in the understanding of the role of CHI involved in the anthocyanins biosynthesis at the molecular level and provide a candidate gene for metabolic engineering of the anthocyanins biosynthesis in sweetpotato. Key words: Purple-fleshed sweetpotato, chalcone isomerase, anthocyanin, expression profile.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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