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Enregistrement W2471484989 · doi:10.1182/blood.v124.21.sci-23.sci-23

miRNAs, Immune Signaling, and Myelodysplastic Syndromes Pathogenesis

2014· article· en· W2471484989 sur OpenAlexaff
Aly Karsan

Notice bibliographique

RevueBlood · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMyeloidCancer researchImmunologyInnate immune systemBone marrowHaematopoiesisMyeloid leukemiaMyelodysplastic syndromesProgenitor cellRUNX1Stem cellImmune systemCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myelodysplastic syndromes (MDS) are a heterogeneous group of clonal stem cell hematologic malignancies characterized by cytopenias as a result of ineffective hematopoiesis and a propensity to progress to acute myeloid leukemia. In low-risk MDS, a characteristic finding in the bone marrow is that of increased apoptosis. The most common structural genomic aberration observed in MDS is the interstitial deletion of the long arm of chromosome 5. MDS with isolated del(5q) is a subtype of MDS characterized by severe anemia and variable neutropenia, but normal or high platelet counts with dysplastic megakaryocytes. MicroRNAs (miRNAs) are short noncoding RNAs capable of exerting their effects by postranscriptionally regulating numerous mRNA targets. We have shown that deletion of chromosome 5q correlates with loss miR-145 and miR-146a that are abundant in hematopoietic stem/progenitor cells (HSPC). Genes involved in innate immune signaling are significantly overrepresented when predicted targets of these two miRNas are surveyed. Specifically, Toll-interleukin-1 receptor domain-containing adaptor protein (TIRAP) and tumor necrosis factor receptor-associated factor-6 (TRAF6) are targets of miR-145 and miR-16a, respectively. Knockdown of miR-145 and miR-146a together or enforced expression of TRAF6, to activate innate immune signaling in mouse HSPC, results in thrombocytosis, mild neutropenia and megakaryocytic dysplasia. A subset of mice transplanted with TRAF6-expressing marrow, in order to aberrantly activate innate immune signaling, progress either to marrow failure or acute myeloid leukemia. Loss of these miRNAs and consequent inappropriate immune signaling results in suppression of HSPC with a relatively greater effect on normal HSPC. Thus, inappropriate activation of innate immune signaling in HSPC phenocopies several general clinical features of low-risk MDS and of del(5q) MDS in particular. Recent work from our group defines additional cytokine pathways that are dysregulated by loss of miR-143 and miR-145. The impact of cytokine dysregulation on HSPC and the marrow microenvironment will be discussed. Disclosures Karsan: Celgene: Research Funding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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