Transmission of Drug-Resistant HIV-1 from an Infected Individual to a Caregiver
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To describe a suspected case of intrafamilial transmission of drug-resistant HIV-1 from an infected individual to his caregiver. METHODS: HIV-1 protease, reverse transcriptase, nef and gp41 DNA sequences were determined from plasma samples after RNA extraction and nested RT-PCR. Phylogenetic trees were generated using neighbour-joining methods. RESULTS: HIV-1 infection was diagnosed in an individual (index) following the death of her HIV-infected adopted son (source). The index case cared for her son in the 9 months prior to his death. No obvious instances of contact with bodily secretions or other traditional risk factors for HIV transmission were identified, although the index case had mild eczema. At time of death, the source case's HIV plasma viral load was > 1,000,000 HIV copies/ml. Genotyping of the protease and reverse transcriptase of both the source and index samples revealed similar drug-resistance mutations despite the index case being antiretroviral-naive. Both source and index V3 genotypes were consistent with syncytium-inducing virus. The mean pairwise amino acid identity between the source and index samples was 97.0%, 99.2%, 92.6% and 94.6% in protease, reverse transcriptase, nef and gp41, respectively. The source and index sequences clustered together on phylogenetic trees when compared with 50 randomly selected sequences from British Columbia. CONCLUSION: Although exceptionally rare, our case demonstrates transmission of drug-resistant HIV-1 from an infected individual to his caregiver in the absence of traditional risk factors. It should be noted that the source had a very high viral load during the terminal phase of his illness.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».