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Enregistrement W2473682917 · doi:10.1177/135965350701200703

Transmission of Drug-Resistant HIV-1 from an Infected Individual to a Caregiver

2007· article· en· W2473682917 sur OpenAlexaff
Chanson J. Brumme, P. Richard Harrigan, Emma C Preston, Winnie Dong, Brian Wynhoven, Carol Murphy, Julio Montaner

Notice bibliographique

RevueAntiviral Therapy · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReverse transcriptaseGenotypingVirologyTransmission (telecommunications)ProteaseBiologyIntegraseIndex caseGenotypeViral loadHuman immunodeficiency virus (HIV)Gp41Drug resistanceGeneticsPolymerase chain reactionEnzymeAntibodyEpitopeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To describe a suspected case of intrafamilial transmission of drug-resistant HIV-1 from an infected individual to his caregiver. METHODS: HIV-1 protease, reverse transcriptase, nef and gp41 DNA sequences were determined from plasma samples after RNA extraction and nested RT-PCR. Phylogenetic trees were generated using neighbour-joining methods. RESULTS: HIV-1 infection was diagnosed in an individual (index) following the death of her HIV-infected adopted son (source). The index case cared for her son in the 9 months prior to his death. No obvious instances of contact with bodily secretions or other traditional risk factors for HIV transmission were identified, although the index case had mild eczema. At time of death, the source case's HIV plasma viral load was > 1,000,000 HIV copies/ml. Genotyping of the protease and reverse transcriptase of both the source and index samples revealed similar drug-resistance mutations despite the index case being antiretroviral-naive. Both source and index V3 genotypes were consistent with syncytium-inducing virus. The mean pairwise amino acid identity between the source and index samples was 97.0%, 99.2%, 92.6% and 94.6% in protease, reverse transcriptase, nef and gp41, respectively. The source and index sequences clustered together on phylogenetic trees when compared with 50 randomly selected sequences from British Columbia. CONCLUSION: Although exceptionally rare, our case demonstrates transmission of drug-resistant HIV-1 from an infected individual to his caregiver in the absence of traditional risk factors. It should be noted that the source had a very high viral load during the terminal phase of his illness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,249
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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