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Enregistrement W2474749895 · doi:10.1093/jpe/rtw071

Population isolation shapes plant genetics, phenotype and germination in naturally patchy ecosystems

2016· article· en· W2474749895 sur OpenAlexafffundabout
Laurent De Vriendt, Marc‐André Lemay, Martine Jean, Sébastien Renaut, Stéphanie Pellerin, Simon Joly, François Belzile, Monique Poulin

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Ecology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotany and Plant Ecology Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityUniversité LavalEspace pour la vie
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyPopulationEcologyIsolation by distanceConservation geneticsPhenotypic traitPopulation geneticsLocal adaptationBiological dispersalEvolutionary biologyGenetic structurePhenotypeGeneticsGenetic variationAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Habitat connectivity is important in conservation since isolation can diminish the potential of a population for adaptation and increase its risk of extinction. However, conservation of naturally patchy ecosystems such as peatlands has mainly focused on preserving specific sites with exceptional characteristics, neglecting the potential interconnectivity between patches. In order to better understand plant dynamics within a peatland network, we assessed the effect of population isolation on genetic distinctiveness, phenotypic variations and germination rates using the peatland-obligate white-fringed orchid (Platanthera blephariglottis). Fifteen phenotypic traits were measured for 24 individuals per population (20 distinct populations, Quebec, Canada) and germination rates of nearly 20000 seeds were assessed. Genetic distinctiveness was quantified for 26 populations using single nucleotide polymorphism markers obtained via a pooled genotyping-by-sequencing approach. Geographic isolation was measured as the distance to the nearest population and as the number of populations occurring in concentric buffer zones (within a radius of 2, 5 and 10 km) around the studied populations. All phenotypic traits showed significant differences among populations. Genetic results also indicated a pattern of isolation-by-distance, which suggests that seed and/or pollen exchange is restricted geographically. Finally, all phenotypic traits, as well as a reduced germination rate, were correlated with either geographic isolation or genetic distance. We conclude that geographic isolation likely restricts gene flow, which in turn may affect germination. Consequently, it is imperative that conservation programs take into account the patchy nature of such ecosystems, rather than targeting a few specific sites with exceptional character for preservation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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