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Enregistrement W2478279870 · doi:10.1007/978-1-61779-474-2

Ubiquitin Family Modifiers and the Proteasome

2012· book· en· W2478279870 sur OpenAlexfundno aff
R. Jürgen Dohmen, Martin Scheffner

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2012
Typebook
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCollege of Pharmacy, University of KentuckyUniversity of North Carolina at Chapel HillSchool of Medicine, New York UniversityUniversität zu KölnDirectorate for Biological SciencesEuskal Herriko UnibertsitateaNational Institutes of HealthRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnTechnische Universität MünchenUniversität KonstanzDeutsches KrebsforschungszentrumCentre National de la Recherche ScientifiqueYale UniversityUniversity of TorontoUniversität StuttgartYork UniversityWellcome TrustJulius-Maximilians-Universität WürzburgUniversität HeidelbergUniversity of DundeeGenentechRIKENLouisiana State UniversityU.S. National Library of MedicineUniversity of PittsburghCalifornia Institute of TechnologyTakeda OncologyUniversity of MinnesotaMassachusetts Institute of Technology
Mots-clésUbiquitinProteasomeCell biologyUbiquitinsUbiquitin ligaseChemistryComputational biologyBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ubiquitin, the founding member of the ubiquitin protein family as well as the enzymology and relevance of its conjugation to substrate proteins for cell biology were discovered in the late 1970s and the 1980s. In recognition of this ground-breaking work, Aaron Ciechanover, Avram Hershko, and Alexander Varshavsky were distinguished with the Lasker basic medical research award in 2000, and Ciechanover, Hershko and Irvin Rose with the Nobel Prize in Chemistry in 2004. It has become clear from many studies that the ubiquitin-proteasome system (UPS) is not only involved in cellular protein quality control, but also in the regulation of many fundamental cellular processes/pathways as well as in their disease-relevant aberrations. The identifi cation of protein modifi cation by the ISG15 protein by Arthur Haas and colleagues marked the discovery of the fi rst ubiquitin-related modifi er in 1992. Since then, a number of protein modifi ers that are structurally or functionally related to ubiquitin, including SUMO, NEDD8, and FAT10 have been identifi ed in eukaryotic cells. All of these proteins, in one way or another, have been linked to the UPS. More recently, the prokaryotic Pup protein has been identifi ed as a protein that, similar to ubiquitin, targets proteins for degradation by the proteasome in mycobacteria expanding the fascinating process of protein-protein modifi cation to the prokaryotic world.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,731
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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