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Enregistrement W2479570197 · doi:10.1128/jvi.01503-16

NF-κB and IRF1 Induce Endogenous Retrovirus K Expression via Interferon-Stimulated Response Elements in Its 5′ Long Terminal Repeat

2016· article· en· W2479570197 sur OpenAlexafffund
Mamneet Manghera, Jennifer Ferguson-Parry, Rongtuan Lin, Renée N. Douville

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of ManitobaMcGill UniversityUniversity of Winnipeg
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for InnovationManitoba Health Research CouncilManitoba Medical Service FoundationALS Association
Mots-clésBiologyIRF1Transcription factorNFKB1InterferonDownregulation and upregulationNF-κBCancer researchTANK-binding kinase 1Tumor necrosis factor alphaInterferon regulatory factorsNeuroinflammationEndogenous retrovirusCell biologyIRF8ImmunologyHMGB1InflammationSignal transductionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Thousands of endogenous retroviruses (ERV), viral fossils of ancient germ line infections, reside within the human genome. Evidence of ERV activity has been observed widely in both health and disease. While this is most often cited as a bystander effect of cell culture or disease states, it is unclear which signals control ERV transcription. Bioinformatic analysis suggests that the viral promoter of endogenous retrovirus K (ERVK) is responsive to inflammatory transcription factors. Here we show that one reason for ERVK upregulation in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is the presence of functional interferon-stimulated response elements (ISREs) in the viral promoter. Transcription factor overexpression assays revealed independent and synergistic upregulation of ERVK by interferon regulatory factor 1 (IRF1) and NF-κB isoforms. Tumor necrosis factor alpha (TNF-α) and LIGHT cytokine treatments of human astrocytes and neurons enhanced ERVK transcription and protein levels through IRF1 and NF-κB binding to the ISREs. We further show that in ALS brain tissue, neuronal ERVK reactivation is associated with the nuclear translocation of IRF1 and NF-κB isoforms p50 and p65. ERVK overexpression can cause motor neuron pathology in murine models. Our results implicate neuroinflammation as a key trigger of ERVK provirus reactivation in ALS. These molecular mechanisms may also extend to the pathobiology of other ERVK-associated inflammatory diseases, such as cancers, HIV infection, rheumatoid arthritis, and schizophrenia. IMPORTANCE: It has been well established that inflammatory signaling pathways in ALS converge at NF-κB to promote neuronal damage. Our findings suggest that inflammation-driven IRF1 and NF-κB activity promotes ERVK reactivation in neurons of the motor cortex in ALS. Thus, quenching ERVK activity through antiretroviral or immunomodulatory regimens may hinder virus-mediated neuropathology and improve the symptoms of ALS or other ERVK-associated diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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