MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2486151394 · doi:10.1158/1557-3125.rasonc14-a14

Abstract A14: Transactivation of the Rho-guanine exchange factor ARHGEF2 by oncogenic K-RAS potentiates invasion-migration in pancreatic ductal adenocarcinoma.

2014· article· en· W2486151394 sur OpenAlexaff
Oliver A. Kent, Maria Jose Sandi Vargas, Robbert Rottapel

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePituitary Gland Disorders and Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransactivationChromatin immunoprecipitationTranscription factorBiologyMAPK/ERK pathwayPromoterCancer researchOncogeneCarcinogenesisAnti-apoptotic Ras signalling cascadeGuanine nucleotide exchange factorKinaseMolecular biologyCell biologySignal transductionCell cycleCellGeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Activating mutations in K-RAS are a ubiquitous feature of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Cellular transformation by oncogenic RAS engages the MAPK pathway and involves Arhgef2, the microtubule-associated RhoGEF a potential oncogene activated downstream of oncogenic RAS. Using luciferase reporters under regulation by the human ARHGEF2 promoter, we have found that GEF-H1 is regulated by oncogenic K-RAS in multiple cell lines and is a transcriptional target of the MAPK and Jun N-terminal kinase (JNK) pathways. Treatment of cell lines with small molecule inhibitors revealed that promoter activity is dependent on MEK1/2, JNK, and TGF-beta associated kinase (TAK1). We have mapped the human ARHGEF2 promoter and found it contains three regulatory elements: a Ras responsive element (RRE), a “core” ETS transcription factor binding region and two distal PTTG binding sites. The RRE is negatively regulated by the Ras responsive element binding protein 1 (RREB1), a known oncogene regulated by oncogenic K-RAS downstream of the MAPK pathway. The ETS core region contains conserved consensus elements for AP-1, ELK1 and SP1 transcription factors (TF). The pituitary tumor-derived transforming gene (PTTG) has been implicated in PDAC tumorigenesis but its link to oncogenic K-RAS is unknown. Using RNAi and luciferase reporters with mutations in TF binding sites in the ARHGEF2 promoter, we have found the transactivation of ARHGEF2 is dependent on the ELK1 and SP1 transcription factors. Chromatin immunoprecipitation has confirmed association of these transcription factors with the endogenous ARHGEF2 promoter in multiple PDAC cell lines. Our results suggest transactivation of ARHGEF2 by oncogenic K-RAS may lead to increased RhoA activity and by extension, account for the highly metastatic potential of PDAC. Citation Format: Oliver A. Kent, Maria Jose Sandi Vargas, Robbert Rottapel. Transactivation of the Rho-guanine exchange factor ARHGEF2 by oncogenic K-RAS potentiates invasion-migration in pancreatic ductal adenocarcinoma.. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on RAS Oncogenes: From Biology to Therapy; Feb 24-27, 2014; Lake Buena Vista, FL. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2014;12(12 Suppl):Abstract nr A14. doi: 10.1158/1557-3125.RASONC14-A14

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,384
Score d'incertitude au seuil0,943

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Cancer ResearchMême sujetPituitary Gland Disorders and TreatmentsTravaux en français237 207