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Enregistrement W2490843426 · doi:10.18632/oncotarget.10661

Small molecule epigenetic screen identifies novel EZH2 and HDAC inhibitors that target glioblastoma brain tumor-initiating cells

2016· article· en· W2490843426 sur OpenAlexafffundabout
Natalie Grinshtein, Constanza Rioseco, Richard Marcellus, David Uehling, Ahmed Aman, Xueqing Lun, Osamu Muto, Lauren Podmore, Jake Lever, Yaoqing Shen, Michael Blough, G. Cairncross, Stephen M. Robbins, Steven J.M. Jones, Marco A. Marra, Rima Al‐awar, Donna L. Senger, David R. Kaplan

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of CalgarySimon Fraser UniversityBC Cancer AgencyOntario Institute for Cancer ResearchCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBC Cancer FoundationStem Cell NetworkTerry Fox Research InstituteBC Cancer AgencyCanada Research ChairsGenome British Columbia
Mots-clésEpigeneticsMedicineGlioblastomaLibrary scienceOncologyCancer researchBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Natalie Grinshtein 1 , Constanza C. Rioseco 1 , Richard Marcellus 2 , David Uehling 2 , Ahmed Aman 2 , Xueqing Lun 3 , Osamu Muto 1 , Lauren Podmore 1 , Jake Lever 4 , Yaoqing Shen 4 , Michael D. Blough 3 , Greg J. Cairncross 3 , Stephen M. Robbins 3 , Steven J. Jones 4, 5, 6 , Marco A. Marra 4, 5 , Rima Al-Awar 2 , Donna L. Senger 3 , David R. Kaplan 1, 7 1 Program in Neurosciences and Mental Health, The Hospital for Sick Children, Toronto, Canada 2 Drug Discovery Group, Ontario Institute for Cancer Research, Toronto, ON, Canada 3 Arnie Charbonneau Cancer Institute, Department of Oncology, Cumming School of Medicine, University of Calgary, Calgary, Alberta, Canada 4 Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre, BC Cancer Agency, Vancouver, Canada 5 Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, British Columbia, Canada 6 Department of Molecular Biology and Biochemistry, Simon Fraser University, Burnaby, British Columbia 7 Department of Molecular Genetics, University of Toronto, Toronto, ON Canada Correspondence to: David R. Kaplan, email: dkaplan@sickkids.ca Keywords: glioblastoma, drug discovery, epigenetics, UNC1999, HDAC inhibitor Received: March 17, 2016      Accepted: July 07, 2016      Published: July 18, 2016 ABSTRACT Glioblastoma (GBM) is the most lethal and aggressive adult brain tumor, requiring the development of efficacious therapeutics. Towards this goal, we screened five genetically distinct patient-derived brain-tumor initiating cell lines (BTIC) with a unique collection of small molecule epigenetic modulators from the Structural Genomics Consortium (SGC). We identified multiple hits that inhibited the growth of BTICs in vitro , and further evaluated the therapeutic potential of EZH2 and HDAC inhibitors due to the high relevance of these targets for GBM. We found that the novel SAM-competitive EZH2 inhibitor UNC1999 exhibited low micromolar cytotoxicity in vitro on a diverse collection of BTIC lines, synergized with dexamethasone (DEX) and suppressed tumor growth in vivo in combination with DEX. In addition, a unique brain-penetrant class I HDAC inhibitor exhibited cytotoxicity in vitro on a panel of BTIC lines and extended survival in combination with TMZ in an orthotopic BTIC model in vivo . Finally, a combination of EZH2 and HDAC inhibitors demonstrated synergy in vitro by augmenting apoptosis and increasing DNA damage. Our findings identify key epigenetic modulators in GBM that regulate BTIC growth and survival and highlight promising combination therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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