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Enregistrement W2504797185 · doi:10.1201/b11113-15

Phylogeographic patterns in Artemia

2011· book-chapter· en· W2504797185 sur OpenAlexaboutno aff
Ilias Kappas, Athanasios D. Baxevanis, Theodore J. Abatzopoulos

Notice bibliographique

RevueCrustacean issues · 2011
Typebook-chapter
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueEvolution and Paleontology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogeographyBiologyEvolutionary biologyGeographyZoologyPhylogeneticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Water fleas of the genus Daphnia (Crustacea: Cladocera) are key components of freshwater ecosystems, being primary consumers of algae and predated by fish and as such, have been extensively studied in the fields of limnology (Peters & de Bernardi 1987) and general ecology (Kalff 2002). In addition to their important ecological role, their wide geographic distribution, phenotypic variation, and peculiar reproductive mode (facultative parthenogenesis) have rendered them important models in evolutionary studies of speciation and adaptation (Schwenk et al. 2004). Extensive genetic surveys have revealed that the once thought cosmopolitan Daphnia species represent complexes of cryptic species with limited geographical distribution (Colbourne et al. 1998; Taylor et al. 1998). Fifteen different complexes were identified upon first sequencing 32 members of the genus Daphnia at the 16S mitochondrial gene (Colbourne & Hebert 1996). In this chapter, I will focus on one of these complexes: the Daphnia pulex complex that includes two major clades (the Daphnia pulicaria and the Daphnia tenebrosa clades) divided into ten divergent mitochondrial lineages (Colbourne et al. 1998). In North America, diploid D. pulex show a longitudinal gradient in their mode of reproduction with obligately asexual populations in eastern (temperate, subarctic, and arctic) Canada, mixed populations in Ontario, and cyclically parthenogenetic populations in western Canada (Hebert & Crease 1983; Hebert et al. 1993). Transitions to obligate parthenogenesis are thought to incur due to meiosis-suppressor genes that disrupt meiosis in females but not in males (Innes & Hebert 1988). As a result, males carrying these genes spread the “asexuality genes” in a contagious fashion. Meiosis-suppressor genes are thought to have arisen in an eastern D. pulex lineage and, hence, may explain the geographical distribution of obligate parthenogenesis in this species (Paland et al. 2005). In addition, glacial advances and retreat have provoked, through isolation in refugia and secondary contacts, hybridization and polyploidizations of numerous lineages of the complex in subarctic and arctic areas (Dufresne & Hebert 1997). Sharp phylogeographical patterns have been found in these young arctic lineages (Weider et al. 1999a; Markova´ et al. 2007) suggesting that historical processes have contributed significantly to the current distribution of these lineages. The recent sequencing of the Daphnia pulex genome will provide additional tools that will greatly contribute to our understanding of speciation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,397
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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