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Enregistrement W2507468470 · doi:10.1080/15592324.2016.1223004

Arabidopsis DDB1-CUL4 E3 ligase complexes in <i>det1</i> salt/osmotic stress resistant germination

2016· article· en· W2507468470 sur OpenAlexaff
Dana F. Schroeder

Notice bibliographique

RevuePlant Signaling & Behavior · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUbiquitin ligaseDDB1BiologyUbiquitinCell biologyGerminationOsmotic shockArabidopsisMutantBiochemistryBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A key regulatory mechanism in plant growth, development, and stress signaling utilizes E3 ubiquitin ligases, which target a variety of substrates for degradation. DE-ETIOLATED 1 (DET1) forms a complex with DDB1 (DAMAGED DNA BINDING protein 1) and CUL4 (CULLIN 4), and negatively regulates light signaling. Another DDB1-CUL4 complex containing DWA1 and DWA2 (DWD hypersensitive to ABA 1 and 2) has been shown to negatively regulate abscisic acid (ABA) signaling. Since distinct DDB1-CUL4 complexes have been shown to influence each other, we analyzed genetic interactions between DET1 and components of DDB1-CUL4 complexes during seed germination under salt and osmotic stress conditions. det1 germination was resistant to salt and osmotic stress and dwa1 and dwa2 enhanced this phenotype. In contrast, ddb1a partially suppressed the det1 germination phenotype on both salt and mannitol, while ddb1b had no effect. Mutations in DDB2, a DDB1-CUL4 complex component involved in DNA repair, also partially suppressed the det1 germination phenotype while mutants in COP1, another light signaling component, completely suppressed the det1 resistant germination phenotypes. Taken together these data suggest that components of E3 ubiquitin ligase complexes have variable but significant effects on det1 salt/osmotic stress responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,374
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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