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Enregistrement W2509400647 · doi:10.1098/rstb.2015.0356

The roadmap for estimation of cell-type-specific neuronal activity from non-invasive measurements

2016· review· en· W2509400647 sur OpenAlexfundno aff
Hana Uhlířová, Kıvılcım Kılıç, Peifang Tian, Sava Sakadžić, Louis Gagnon, Martin Thunemann, Michèle Desjardins, Payam A. Saisan, Krystal Nizar, Mohammad A. Yaseen, Donald J. Hagler, Matthieu Vandenberghe, Srdjan Djurovic, Ole A. Andreassen, Gabriel A. Silva, Eliezer Masliah, David Kleinfeld, Sergei A. Vinogradov, Richard B. Buxton, Gaute T. Einevoll, David A. Boas, Anders M. Dale, Anna Devor

Notice bibliographique

RevuePhilosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences · 2016
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute on Drug AbuseNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of California, San DiegoTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma KurumuNational Institutes of HealthCentral European Institute of TechnologyNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingInternational Headache SocietyDeutsche ForschungsgemeinschaftNorges ForskningsrådMinisterstvo Školství, Mládeže a Tělovýchovy
Mots-clésEstimationBiologyNeuroscienceComputer scienceComputational biologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The computational properties of the human brain arise from an intricate interplay between billions of neurons connected in complex networks. However, our ability to study these networks in healthy human brain is limited by the necessity to use non-invasive technologies. This is in contrast to animal models where a rich, detailed view of cellular-level brain function with cell-type-specific molecular identity has become available due to recent advances in microscopic optical imaging and genetics. Thus, a central challenge facing neuroscience today is leveraging these mechanistic insights from animal studies to accurately draw physiological inferences from non-invasive signals in humans. On the essential path towards this goal is the development of a detailed 'bottom-up' forward model bridging neuronal activity at the level of cell-type-specific populations to non-invasive imaging signals. The general idea is that specific neuronal cell types have identifiable signatures in the way they drive changes in cerebral blood flow, cerebral metabolic rate of O2 (measurable with quantitative functional Magnetic Resonance Imaging), and electrical currents/potentials (measurable with magneto/electroencephalography). This forward model would then provide the 'ground truth' for the development of new tools for tackling the inverse problem-estimation of neuronal activity from multimodal non-invasive imaging data.This article is part of the themed issue 'Interpreting BOLD: a dialogue between cognitive and cellular neuroscience'.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0020,006
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,199
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,132 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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