229: Improved Disease-Free Survival with Adjuvant Radiation Therapy (RT) in Patients with Stage IIIC2 Endometrial Carcinoma – Experience From Two Provinces
Notice bibliographique
Résumé
Purpose: Recent sequencing efforts have allowed for the molecular taxonomy of prostate cancer (TCGA, 2015).In a subset of patients, mutations and copy-number losses in the homologous recombination pathway were found.The TONSL-MMS22L complex has recently been shown to be involved in the recovery from replication stress through homologous recombination (Duro et al, 2010; O'Donnell et al, 2010).It physically associates with BRCA1/2, RAD51, and RPA.Our study sought to correlate TONSL complex expression with biochemical relapse in prostate cancer patients Methods and Materials: Our cohort consists of 250 patients with D'Amico-classified intermediate-risk prostate cancer, treated with image-guided radiotherapy (IGRT, n = 116) or radical prostatectomy (RadP, n = 134).Pre-treatment biopsies were analyzed using the Affymetrix Oncoscan array.The Phoenix and AUA criteria was used to define biochemical relapse for RadP and IGRT patients respectively.mRNA expression data was taken from the TCGA Provisional cohort using cBioPortal (Gao et al., 2013). Results:Copy number alterations of TONSL and MMS22L were observed in 31% (n = 78) and 20% (n = 51) of our cohort respectively.They were predominantly gains in TONSL, but losses in MMS22L.TONSL amplification, but not MMS22L, was significantly associated with biochemical recurrence (Chi-square = 12, p < 0.001).TONSL remained significantly associated on multivariate analysis, controlling for tumour stage, Gleason score, and PSA (p < 0.005).In the TCGA cohort, over-expression of TONSL (p < 0.005) as well as other members of the homologous recombination pathway (e.g.RAD51D, BRCA1, XRCC2, POLD1, TOP3A, etc.) were associated with disease recurrence (p < 0.001). Conclusions:We identified a novel association of copy-number gain and over-expression of TONSL with biochemical recurrence following radical prostatectomy or image-guided radiotherapy.This points to a potential gene dosage effect and the central role of the homologous recombination pathway in prostate cancer progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».