Profiling of p5, a 24 Amino Acid Inhibitory Peptide Derived from the CDK5 Activator, p35 CDKR1 Against 70 Protein Kinases
Notice bibliographique
Résumé
Cyclin-dependent kinase 5 (CDK5) is a multifunctional serine/threonine kinase that regulates a large number of neuronal processes essential for nervous system development and function with its activator p35 CDK5R1. Upon neuronal insults, p35 is proteolyzed and cleaved to p25 producing deregulation and hyperactivation of CDK5 (CDK5/p25), implicated in tau hyperphosphorylation, a pathology in some neurodegenerative diseases. A truncated, 24 amino acid peptide, p5, derived from p35 inhibits the deregulated CDK5 phosphotransferase activity and ameliorates Alzheimer's disease (AD) phenotypes in AD model mice. In the present study, we have screened a diverse panel of 70 human protein kinases for their sensitivities to p5, and a subset of these to p35. At least 16 of the tested protein kinases exhibited IC50 values that were 250 μM or less, with CAMK4, ZAP70, SGK1, and PIM1 showing greater sensitivity to inhibition by p5 than CDK5/p35 and CDK5/p25. In contrast, the p5 peptide modestly activated LKB1 and GSK3β. A sub set of kinases screened against p35 showed that activity of CAMK4 in the absence of calcium and calmodulin was also markedly inhibited by p35. The Cyclin Y-dependent kinases PFTK1 (CDK14) and PCTK1 (CDK16) were activated by p35 at least 10-fold in the absence of Cyclin Y and by approximately 50% in its presence. These findings provide additional insights into the mechanisms of action for p5 and p35 in the regulation of protein phosphorylation in the nervous system.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».