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Enregistrement W2513667454 · doi:10.54846/jshap/393

Genetic diversity and possible avenues of dissemination of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in two geographic regions of Mexico

2004· article· en· W2513667454 sur OpenAlexaff
Laura Batista, Carlos Pijoan, Humphrey M. Lwamba, Craig R. Johnson, Michael P. Murtaugh

Notice bibliographique

RevueJournal of Swine Health and Production · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPorcine reproductive and respiratory syndrome virusGenetic diversityDiversity (politics)VirusBiologyVirologyEvolutionary biologyGeographyComputational biologyMedicineEnvironmental healthAnthropologySociologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: To determine the range of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) genetic variation and possible avenues of dissemination in geographically separated swine herds in Mexico. Methods: Pooled serum samples (n=33) from suspected viremic sows and nursery and finisher pigs from 13 sites in the state of Sonora (northwest Mexico) and six sites in Puebla (south-central region) were subjected to PRRSV polymerase chain reaction amplification, purification, and sequencing. Results: Thirty-four PRRSV open reading frame 7 (ORF7) sequences were generated from a total of 31 isolates from 13 sites in Sonora and six in Puebla. The nucleotide similarity of ORF7 among isolates ranged from 86 to 100%. Phylogenetic analysis revealed no obvious geographic, temporal, or other characteristics that accounted for the observed distribution of isolates. Implications: DNA sequence analysis revealed unexpectedly high levels of genetic variation among and within swine-rearing regions in Mexico, suggesting independent PRRSV introductions. Re-isolation of a vaccinal strain of PRRSV suggests importation of vaccinated animals or semen or surreptitious use. The diversity and distribution of viral genotypes indicates that the mechanisms of geographic spread were complex, such that effective control may present a substantial epidemiological challenge.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,171

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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