Genetic diversity and possible avenues of dissemination of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in two geographic regions of Mexico
Notice bibliographique
Résumé
Objective: To determine the range of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) genetic variation and possible avenues of dissemination in geographically separated swine herds in Mexico. Methods: Pooled serum samples (n=33) from suspected viremic sows and nursery and finisher pigs from 13 sites in the state of Sonora (northwest Mexico) and six sites in Puebla (south-central region) were subjected to PRRSV polymerase chain reaction amplification, purification, and sequencing. Results: Thirty-four PRRSV open reading frame 7 (ORF7) sequences were generated from a total of 31 isolates from 13 sites in Sonora and six in Puebla. The nucleotide similarity of ORF7 among isolates ranged from 86 to 100%. Phylogenetic analysis revealed no obvious geographic, temporal, or other characteristics that accounted for the observed distribution of isolates. Implications: DNA sequence analysis revealed unexpectedly high levels of genetic variation among and within swine-rearing regions in Mexico, suggesting independent PRRSV introductions. Re-isolation of a vaccinal strain of PRRSV suggests importation of vaccinated animals or semen or surreptitious use. The diversity and distribution of viral genotypes indicates that the mechanisms of geographic spread were complex, such that effective control may present a substantial epidemiological challenge.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».