<i>Blueberry fruit drop-associated virus</i>: A New Member of the Family <i>Caulimoviridae</i> Isolated From Blueberry Exhibiting Fruit-Drop Symptoms
Notice bibliographique
Résumé
This study describes the nucleotide sequence and genome organization of a new DNA virus isolated from 'Bluecrop' blueberry plants exhibiting fruit-drop symptoms and named Blueberry fruit drop-associated virus (BFDaV). Blueberry fruit drop disease was first detected in blueberry plants in British Columbia, Canada in the late 1990s, and in a single field in northern Washington state in the United States in 2012. Infected bushes abort nearly 100% of their fruit about three weeks prior to harvest, when the berries are about 3 to 5 mm in diameter. At harvest, the affected plants appear taller than healthy ones as there is no fruit weighing down the branches. The virus was amplified from diseased material using rolling circle amplification, followed by enzyme digestion, cloning, and sequencing. The full genome of BFDaV is 9,850 bp in length and contains a single open reading frame, encoding for a polyprotein, and a large noncoding region. Based on the genome size and organization and phylogenetics, BFDaV is proposed as a new and the largest member of family Caulimoviridae. Finally, in mapping part of a field with fruit-drop symptoms, there was a nearly perfect correlation between the presence of the virus and fruit-drop symptoms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».