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Enregistrement W2515871073 · doi:10.1038/srep32118

A novel inhibitory effect of oxazol-5-one compounds on ROCKII signaling in human coronary artery vascular smooth muscle cells

2016· article· en· W2515871073 sur OpenAlexafffund
Abdulhameed Al‐Ghabkari, Jingti Deng, Paul C. McDonald, Shoukat Dedhar, Mana Alshehri, Michael P. Walsh, Justin A. MacDonald

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesAlberta Innovates - Health SolutionsHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésCofilinPhosphorylationRho-associated protein kinaseVascular smooth muscleMyosin light-chain kinaseBiochemistryBiologyMyosinKinaseIn silicoIn vitroCytoskeletonCell biologyActin cytoskeletonSmooth muscleCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The selectivity of (4Z)-2-(4-chloro-3-nitrophenyl)-4-(pyridin-3-ylmethylidene)-1,3-oxazol-5-one (DI) for zipper-interacting protein kinase (ZIPK) was previously described by in silico computational modeling, screening a large panel of kinases, and determining the inhibition efficacy. Our assessment of DI revealed another target, the Rho-associated coiled-coil-containing protein kinase 2 (ROCKII). In vitro studies showed DI to be a competitive inhibitor of ROCKII (Ki, 132 nM with respect to ATP). This finding was supported by in silico molecular surface docking of DI with the ROCKII ATP-binding pocket. Time course analysis of myosin regulatory light chain (LC20) phosphorylation catalyzed by ROCKII in vitro revealed a significant decrease upon treatment with DI. ROCKII signaling was investigated in situ in human coronary artery vascular smooth muscle cells (CASMCs). ROCKII down-regulation using siRNA revealed several potential substrates involved in smooth muscle contraction (e.g., LC20, Par-4, MYPT1) and actin cytoskeletal dynamics (cofilin). The application of DI to CASMCs attenuated LC20, Par-4, LIMK, and cofilin phosphorylations. Notably, cofilin phosphorylation was not significantly decreased with a novel ZIPK selective inhibitor (HS-38). In addition, CASMCs treated with DI underwent cytoskeletal changes that were associated with diminution of cofilin phosphorylation. We conclude that DI is not selective for ZIPK and is a potent inhibitor of ROCKII.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,573

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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