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Enregistrement W2516607805 · doi:10.1142/s0218339016500157

COMPUTATIONAL EVIDENCE FROM TWO CORRELATED DATA SOURCES AT DIFFERENT MOLECULAR LEVELS FOR AF-VHD-SPECIFIC MICRORNA SIGNATURE

2016· article· en· W2516607805 sur OpenAlex
Wei Feng, Nini Rao, Yong-Li Wan, San Li, Ji Zheng, Wei Zeng, Guangbin Wang, Xu Chen

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Systems · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Guangdong ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaMcMaster UniversityNational Science Foundation
Mots-clésmicroRNAComputational biologyMechanism (biology)BiologyAtrial fibrillationIdentification (biology)DiseaseMicroarrayBioinformaticsGeneGene expressionMedicineGeneticsPathologyCardiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The important roles of microRNAs (miRNAs) in the pathological process of the cardiovascular system have been recognized. However, identification of miRNAs related to valvular heart disease with atrial fibrillation (AF-VHD) has been difficult and very slow because of complex pathological mechanism of AF-VHD. Analysis of microarray expression profiles provides the possibility to rapid prediction of disease-regulating miRNAs and can lay a theoretical foundation for further experimental studies. A computational method is proposed to predict AF-VHD-specific miRNAs by combining miRNA and gene expression data, which are strongly correlated. Using the proposed method, a 45-miRNA AF-VHD-specific signature is predicted. Compared with other related results, 15 of 45 miRNAs are the same and the rest 30 miRNAs are different. Our analysis shows that 11 of 30 new miRNAs are associated with the diseases inducing AF-VHD and the remaining 19 miRNAs have good combinational discrimination power. Therefore, the AF-VHD signature we have predicted is confirmed to be reliable and specific. In a word, this study proposes an effective computational strategy in prediction of disease-regulating miRNAs and finds some AF-VHD-specific miRNAs, which provides new insight into the further experimental study and molecular mechanism leading to the development of AF-VHD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,240
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle