ERAP1-ERAP2 dimers trim MHC I-bound precursor peptides; implications for understanding peptide editing
Notice bibliographique
Résumé
The processing of MHC class I antigenic precursor peptides by the endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 (ERAP1) and ERAP2 is an important event in the cell biology of antigen presentation. To date, the molecular context by which the ERAP enzymes trim precursor peptides, and how ERAPs shape peptide repertoires, remain open questions. Using ERAP1 and ERAP2 heterodimers (ERAP1/2), and N-terminally extended model and natural peptides in their free and HLA-B*0801-bound forms, we characterized the mode of action of ERAPs. We provide evidence that ERAP1/2 can trim MHC I-bound precursor peptides to their correct and final lengths, albeit more slowly than the corresponding free precursors. Trimming of MHC I-bound precursors by ERAP1/2 increases the conformational stability of MHC I/peptide complexes. From the data, we propose a molecular mechanistic model of ERAP1/2 as peptide editors. Overall, our study provides new findings on a significant issue of the ERAP-mediated processing pathway of MHC class I antigens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».