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Enregistrement W2517776895

Bacterial Antagonism and Plant Growth Promoting Traits of Actinobacterial Strains Previously Selected for their Antifungal Properties

2016· article· en· W2517776895 sur OpenAlexaff
Lamia Aouar, Sylvain Lerat, Abbderrahmane Boulahrouf, Carole Beaulieu

Notice bibliographique

RevueTransylvanian Review · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySiderophoreStreptomycesMicrobiologyPectobacterium carotovorumErwiniaAgrobacteriumAgar plateAgrobacterium tumefaciensBacteriaStreptomyces griseusRhizobacteriaBotanyPathogenRhizosphereTransformation (genetics)Biochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background : Six rhizospheric actinobacteria previously selected for their antifungal properties ( Streptomyces griseus Lac1, Streptomyces rochei Lac3, Streptomyces anulatus Pru14, Streptomyces champavatii Pru16, Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei Vic8 and Nocardiopsis alba Pin10) were tested against plant pathogenic bacteria and for several beneficial traits promoting plant growth. Materials and methods: In vitro antagonism assay was determined by the plate diffusion method against phytopathogenic bacteria ( Streptomyces scabiei EF-35, Agrobacterium tumefaciens AL3, Erwinia amylovora SL1 and  Pectobacterium carotovorum CB2). In planta assay was performed on radish seedlings infected with S. scabies EF-35, using growth pouches. The root growth was estimated by analysis of data with the Winrhizo software. The indole-3-acetic acid  (auxin) and siderophore were produced in liquid culture, detected by colorimetric assay and quantified by HPLC.  Phosphate  solubilization was determined  on Pikovskaya’s agar. Results : Three of the six actinobacterial strains tested in vitro inhibited at least one (out of four) pathogenic bacterium. Strain Lac1 showed the largest growth inhibition spectrum (against Streptomyces scabiei EF-35, Agrobacterium tumefaciens AL3 and Erwinia amylovora SL1), while no actinobacterial strain showed the ability to inhibit the growth of Pectobacterium carotovorum CB2. During in vivo assays, strain Lac1 was the only bacterium to suppress the negative effects on the plant pathogen. All strains presented one or several characteristics of plant growth-promoting rhizobacteria such as indole-3-acetic acid production, phosphate solubilization and siderophores production. Conclusion : This investigation revealed the potential abilities of the six strains for the biological control of plant pathogens, Lac1 emerged as the most promising biocontrol agent. Key words : Actinobacteria, bacterial antagonism, IAA, phosphate solubilisation, siderophores.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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