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Enregistrement W2518320356 · doi:10.13034/jsst.v9i1.90

Planarian Regeneration in Response to Drug Disruption of the Wnt and MAPK Pathways

2016· article· en· W2518320356 sur OpenAlexvenueno aff
Yong Shen, Thomas H. A. Etheridge, Eric J. Hsu, Shankar G. Kaushal

Notice bibliographique

RevueJournal of Student Science and Technology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlanarian Biology and Electrostimulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlanarianWnt signaling pathwayRegeneration (biology)MAPK/ERK pathwayBiologyCell biologySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The regenerative ability of planarians depends largely on its complex signaling pathways. The Wnt pathway regulates the A/P polarity formation after regeneration, while the MAPK pathway plays a role in regeneration. This experiment uses various drugs to disrupt the aforementioned pathways. Imatinib targets the RTKs, which play a role in the Wnt pathway. PZQ is expected to affect the Wnt noncanonical calcium pathway. EHT 1864 inhibits Rac1, a GTPase involved in the noncanonical PCP pathway. Finally, U0126 disrupts the MAPK pathway whose activity induces blastemic cell differentiation. After drug treatment, abnormal planarian regeneration is expected. The drug assays showed that while both Imatinib and PZQ have no effect on planarian regeneration, EHT 1864 under high concentration has a potent effect on the viability of planarians during regeneration. Furthermore, U0126 caused cyclopia in planarians under high concentrations. These observations suggest that the RTKs play a limited role in planarian regeneration, Rac1 plays a greater role than just A/P determination during regeneration, and that U0126 affects eye and head regeneration. Our findings also show an inconsistency with another research group’s study regarding the effects of PZQ on planarian polarity formation. L’abilité regénérative des planaires dépend largement sur la complexité des ses voies de signalisation. La voie des Wnt contrôle la formation de la polarité des potentiels d’action après la regénération, alors que la voie de la MAPK joue un rôle dans la regénération. L’imatinib cible les RTK, eux-mêmes jouant un rôle dans la voie des Wnt. Praziquantel est attendu d’affecter la voie de calcium non canonique des Wnt. L’EHT 1864 inhibe la Rac1, un GTPase impliqué dans la voie non canonique du PCP. Finalement, U0126 perturbe la voie de la MAPK, l’activité de laquelle induit la différentiation des cellules souches blastémiques. Après traitement avec de la drogue, de la regénération anormale des planaires est attendue. Les essais des drogues ont démontré que, bien que Imatinib et PZQ n’ont pas d’effets sur la regénération des planaires, l’EHT 1864 en haute concentration a un effet potent sur la viabilité des planaires durant la regénération. De plus, l’U0126 a causé la cyclopie chez les planaires en haute concentration. Ces observations suggère que les RTK jouent un rôle limité dans la regénération de planaires, la Rac1 joue un rôle plus important que simplement déterminer des potentiels d’action durant la regénération et l’U0126 affecte les regénérations des yeux et de la tête. Nos découvertes indiquent aussi des incohérences avec une étude par un autre groupe au sujet des effets du PZQ sur la formation polaire des planaires.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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