A Novel Plasmid, pSx1, Harboring a New Tn <i>1696</i> Derivative from Extensively Drug-Resistant <i>Shewanella xiamenensis</i> Encoding OXA-416
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The whole genome sequencing of extensively drug-resistant Shewanella xiamenensis T17 isolated from hospital effluents in Algeria revealed the presence of a novel 268.4 kb plasmid designated pSx1, which carries several antibiotic-resistance genes in the novel Tn 1696 derivative (Tn 6297 ), in addition to the chromosomal bla OXA-48 -like gene ( bla OXA-416 ). The presence of the plasmid was confirmed by nuclease S1-PFGE analysis and transformation by electroporation into Escherichia coli DH10B. Tn 6297 contains an In27 class 1 integron harboring the dfrA12-orfF-aadA2 array, msr(E) and mph(E) associated with IS 26 ; a new efflux pump multidrug resistance composite transposon delimited by two IS Ec29 s; Tn-tet harboring tetR and tetA (C); a class 1 integron with the qacG gene cassette ; qnrVC6 and dfrA23 associated with IS CR1 ; and a complex class 1 integron In4-like containing aacC1, aadA1, bla VEB-16 , catA2 , sul1Δ , cmlA9 , tetR , tetA (G), aac(6′)-II , and bla PSE-1 . Its mer operon carries merB , but lacks merC , in contrast to Tn 1696 and Tn 21 . This study represents the first characterization of a multidrug-resistant transposon and multidrug resistance plasmid in Shewanella and is the first report of bla OXA-416 in Algeria, providing evidence that Shewanella spp. could be an important reservoir and vehicle for drug resistance genes.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle