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Enregistrement W2519037588 · doi:10.1089/mdr.2016.0025

A Novel Plasmid, pSx1, Harboring a New Tn <i>1696</i> Derivative from Extensively Drug-Resistant <i>Shewanella xiamenensis</i> Encoding OXA-416

2016· article· en· W2519037588 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMicrobial Drug Resistance · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversité de MontréalPublic Health Agency of CanadaInstitut National de Santé Publique du Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntegronPlasmidGene cassetteBiologyTetRTransposable elementMicrobiologyMultiple drug resistanceTransposon mutagenesisEscherichia coliEffluxOperonGeneticsGeneDrug resistanceGenomeRepressor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The whole genome sequencing of extensively drug-resistant Shewanella xiamenensis T17 isolated from hospital effluents in Algeria revealed the presence of a novel 268.4 kb plasmid designated pSx1, which carries several antibiotic-resistance genes in the novel Tn 1696 derivative (Tn 6297 ), in addition to the chromosomal bla OXA-48 -like gene ( bla OXA-416 ). The presence of the plasmid was confirmed by nuclease S1-PFGE analysis and transformation by electroporation into Escherichia coli DH10B. Tn 6297 contains an In27 class 1 integron harboring the dfrA12-orfF-aadA2 array, msr(E) and mph(E) associated with IS 26 ; a new efflux pump multidrug resistance composite transposon delimited by two IS Ec29 s; Tn-tet harboring tetR and tetA (C); a class 1 integron with the qacG gene cassette ; qnrVC6 and dfrA23 associated with IS CR1 ; and a complex class 1 integron In4-like containing aacC1, aadA1, bla VEB-16 , catA2 , sul1Δ , cmlA9 , tetR , tetA (G), aac(6′)-II , and bla PSE-1 . Its mer operon carries merB , but lacks merC , in contrast to Tn 1696 and Tn 21 . This study represents the first characterization of a multidrug-resistant transposon and multidrug resistance plasmid in Shewanella and is the first report of bla OXA-416 in Algeria, providing evidence that Shewanella spp. could be an important reservoir and vehicle for drug resistance genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,134
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle