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Enregistrement W2519305629 · doi:10.2196/resprot.6346

Protocol Outlines for Parts 1 and 2 of the Prospective Endoscopy III Study for the Early Detection of Colorectal Cancer: Validation of a Concept Based on Blood Biomarkers

2016· article· en· W2519305629 sur OpenAlexvenueno aff
Louise Rasmussen, Michael Wilhelmsen, Ib Jarle Christensen, Jens Andersen, Lars Nannestad Jørgensen, Morten Rasmussen, Jakob Hendel, Mogens Rørbæk Madsen, Jesper Vilandt, Thore Hillig, Michael Klærke, Anna‐Marie Bloch Münster, Lars Maagaard Andersen, Berit Andersen, Nete Hornung, Erland J. Erlandsen, Ali Khalid

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAugustinus FondenAbbott Laboratories
Mots-clésColorectal cancerMedicineProtocol (science)Prospective cohort studyMedical physicsCancerOncologyInternal medicinePathologyAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Programs for population screening of colorectal cancer (CRC) have been implemented in several countries with fecal immunochemical testing (FIT) as the preferred platform. However, the major obstacle for a feces-based testing method is the limited compliance that reduces the clinical sensitivity for detection of participants with non-symptomatic CRC. Therefore, research approaches have been initiated to develop screening concepts based on biomarkers in blood. Preliminary results show that protein, genetic, epigenetic, and metabolomic components may be valuable in blood-based screening concepts, particularly when combinations of the various components appear to lead to significant improvements. OBJECTIVES: The protocol described in this paper focuses on the validation of concepts based on biomarkers in blood in a major population screened by FIT. METHODS: In Part 1, participants will be identified and included through the Danish CRC Screening Program comprising initial FIT and subsequent colonoscopy to those with a positive result. Blood samples will be collected from 8000 FIT-positive participants, who are offered subsequent colonoscopy. Findings and interventions at colonoscopy together with personal data including co-morbidity will be recorded. Blood samples and data will also be collected from 6000 arbitrarily chosen participants with negative FIT. In Part 2, blood samples and data will be collected from 30,000 FIT-negative participants three times within 4 years. The blood samples will be analyzed using various in-house and commercially available manual and automated analysis platforms. RESULTS: We anticipate Part 1 to terminate late August 2016 and Part 2 to terminate late September 2022. The results from Parts 1 and 2 will be presented within 12 to 18 months from termination. CONCLUSIONS: The purpose of this study is to improve the efficacy of identifying participants with neoplastic bowel lesions, to identify false negative participants, to identify participants at risk of interval neoplastic lesions, to improve the compliance in screening sessions, and to establish guidelines for out-patient follow-up of at-risk participants based on combinations of blood-based biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,066
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,068
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0660,068
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0880,034

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,480
Écart entre enseignants0,362 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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